Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shisal1Q0VBP7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shisal1Q0VBP7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shisal1Q0VBP7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shisal1Q0VBP7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shisal1Q0VBP7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Shisal1Q0VBP7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Shisal1Q0VBP7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shisal1Q0VBP7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shisal1Q0VBP7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisal1Q0VBP7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shisal1Q0VBP7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisal1Q0VBP7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shisal1Q0VBP7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shisal1Q0VBP7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shisal1Q0VBP7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shisal1Q0VBP7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shisal1Q0VBP7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shisal1Q0VBP7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shisal1Q0VBP7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisal1Q0VBP7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shisal1Q0VBP7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shisal1Q0VBP7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shisal1Q0VBP7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shisal1Q0VBP7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shisal1Q0VBP7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shisal1Q0VBP7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shisal1Q0VBP7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shisal1Q0VBP7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Shisal1Q0VBP7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shisal1Q0VBP7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shisal1Q0VBP7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shisal1Q0VBP7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shisal1Q0VBP7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisal1Q0VBP7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shisal1Q0VBP7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Shisal1Q0VBP7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shisal1Q0VBP7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shisal1Q0VBP7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shisal1Q0VBP7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Shisal1Q0VBP7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shisal1Q0VBP7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisal1Q0VBP7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisal1Q0VBP7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisal1Q0VBP7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisal1Q0VBP7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shisal1Q0VBP7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shisal1Q0VBP7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shisal1Q0VBP7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Shisal1Q0VBP7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shisal1Q0VBP7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shisal1Q0VBP7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shisal1Q0VBP7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shisal1Q0VBP7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shisal1Q0VBP7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shisal1Q0VBP7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shisal1Q0VBP7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shisal1Q0VBP7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shisal1Q0VBP7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shisal1Q0VBP7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shisal1Q0VBP7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shisal1Q0VBP7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shisal1Q0VBP7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shisal1Q0VBP7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shisal1Q0VBP7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shisal1Q0VBP7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shisal1Q0VBP7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Shisal1Q0VBP7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Shisal1Q0VBP7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shisal1Q0VBP7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Shisal1Q0VBP7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Shisal1Q0VBP7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Shisal1Q0VBP7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Shisal1Q0VBP7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Shisal1Q0VBP7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shisal1Q0VBP7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shisal1Q0VBP7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shisal1Q0VBP7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Shisal1Q0VBP7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Shisal1Q0VBP7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Shisal1Q0VBP7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Shisal1Q0VBP7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Shisal1Q0VBP7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shisal1Q0VBP7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shisal1Q0VBP7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shisal1Q0VBP7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shisal1Q0VBP7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shisal1Q0VBP7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shisal1Q0VBP7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shisal1Q0VBP7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shisal1Q0VBP7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shisal1Q0VBP7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shisal1Q0VBP7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shisal1Q0VBP7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shisal1Q0VBP7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shisal1Q0VBP7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shisal1Q0VBP7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shisal1Q0VBP7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms