Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms