Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,35■■■■■ 4,05
Prdm6Q3UZD5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Prdm6Q3UZD5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Prdm6Q3UZD5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
Prdm6Q3UZD5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Prdm6Q3UZD5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Prdm6Q3UZD5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Prdm6Q3UZD5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Prdm6Q3UZD5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Prdm6Q3UZD5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,59■■■□□ 2,97
Prdm6Q3UZD5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Prdm6Q3UZD5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Prdm6Q3UZD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Prdm6Q3UZD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Prdm6Q3UZD5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Prdm6Q3UZD5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Prdm6Q3UZD5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Prdm6Q3UZD5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Prdm6Q3UZD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Prdm6Q3UZD5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Prdm6Q3UZD5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Prdm6Q3UZD5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Prdm6Q3UZD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Prdm6Q3UZD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Prdm6Q3UZD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Prdm6Q3UZD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Prdm6Q3UZD5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Prdm6Q3UZD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Prdm6Q3UZD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,98■■■□□ 2,55
Prdm6Q3UZD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,98■■■□□ 2,55
Prdm6Q3UZD5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Prdm6Q3UZD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Prdm6Q3UZD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Prdm6Q3UZD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Prdm6Q3UZD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Prdm6Q3UZD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Prdm6Q3UZD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Prdm6Q3UZD5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Prdm6Q3UZD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Prdm6Q3UZD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Prdm6Q3UZD5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Prdm6Q3UZD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Prdm6Q3UZD5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Prdm6Q3UZD5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Prdm6Q3UZD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Prdm6Q3UZD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Prdm6Q3UZD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Prdm6Q3UZD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Prdm6Q3UZD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Prdm6Q3UZD5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Prdm6Q3UZD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Prdm6Q3UZD5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Prdm6Q3UZD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Prdm6Q3UZD5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Prdm6Q3UZD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Prdm6Q3UZD5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Prdm6Q3UZD5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Prdm6Q3UZD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Prdm6Q3UZD5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Prdm6Q3UZD5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Prdm6Q3UZD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prdm6Q3UZD5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prdm6Q3UZD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Prdm6Q3UZD5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Prdm6Q3UZD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Prdm6Q3UZD5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Prdm6Q3UZD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Prdm6Q3UZD5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Prdm6Q3UZD5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Prdm6Q3UZD5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Prdm6Q3UZD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Prdm6Q3UZD5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Prdm6Q3UZD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Prdm6Q3UZD5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Prdm6Q3UZD5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Prdm6Q3UZD5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Prdm6Q3UZD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Prdm6Q3UZD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Prdm6Q3UZD5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Prdm6Q3UZD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Prdm6Q3UZD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Prdm6Q3UZD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Prdm6Q3UZD5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Prdm6Q3UZD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Prdm6Q3UZD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Prdm6Q3UZD5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Prdm6Q3UZD5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Prdm6Q3UZD5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Prdm6Q3UZD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Prdm6Q3UZD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Prdm6Q3UZD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Prdm6Q3UZD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Prdm6Q3UZD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Prdm6Q3UZD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Prdm6Q3UZD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Prdm6Q3UZD5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Prdm6Q3UZD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Prdm6Q3UZD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Prdm6Q3UZD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Prdm6Q3UZD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,3 ms