RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q6ZRX8 168 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 C20orf197Q8N268 126 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 BANF2Q9H503 90 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 CALML5Q9NZT1 146 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPN13Q12923 2485 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 J3KT08 172 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPM2O94777 84 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 S100GP29377 79 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR8B8Q15620 311 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLLU1Q5K131 121 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 COX7B2Q8TF08 81 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 VWFP04275 2813 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF815PA8K554 130 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 HLA-DRB4P13762 266 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-344P-201ENST00000516635 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNFSF15O95150 251 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 GCHFRP30047 84 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 V9GYV3 84 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 PARP14Q460N5 1801 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SYNJ1O43426 1573 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMIM24O75264 130 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBP4P02753 201 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFA11Q86Y39 141 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 CENPHQ9H3R5 247 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 V9GYQ6 96 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 ERCC6Q03468 1493 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 G3V318 75 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 J3QLW9 94 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 CMPK1P30085 196 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 INSL4Q14641 139 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPCS2Q15005 226 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 ERG28Q9UKR5 140 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R129 80 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEGS1O15121 323 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRM1P04553 51 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPRR2DP22532 72 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDA1Q9BW61 102 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A1B0GX51 115 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R2P5 195 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R3E3 92 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCTP09683 121 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 BATF3Q9NR55 127 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 GINS2Q9Y248 185 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSTD3H0UI37 97 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC179H3BU77 68 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-344P-201ENST00000516635 EDDM3BP56851 147 aa-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms