RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 CirbpP60824 172 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tbr1Q64336 681 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Muc15Q8C6Z1 331 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cldn23Q9D7D7 296 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 CrebbpP45481 2441 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ucp2P70406 309 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dlx6P70397 175 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Bsph1Q3UW26 133 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1350Q8VF34 308 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gpr132Q9Z282 382 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dkk1O54908 272 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Shisa3Q3UPR0 238 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm10190Q8BSD7 107 aa14.59□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa14.58□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rnf115Q9D0C1 305 aa14.58□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Myoz1Q9JK37 296 aa14.58□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa14.58□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 D630044L22RikQ8C701 164 aa14.58□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Scgb1b19F6WYW0 93 aa14.58□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dnase2bQ9QY48 354 aa14.58□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Defa-rs7P50715 91 aa14.58□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr150Q60895 312 aa14.58□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mrpl20Q9CQL4 149 aa14.58□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm12355A2A4X6 163 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Srsf3P84104 164 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 EsdQ9R0P3 282 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 LfngO09010 378 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dtx1Q61010 627 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trpm7Q923J1 1863 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Foxc2Q61850 494 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1178Q7TR20 323 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Klf12O35738 402 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 SellP18337 372 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 SftpcP21841 193 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm12888Q3UW77 119 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1258Q8VGN6 311 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hdgfl3Q9JMG7 202 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Shisa6Q3UH99 525 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr263Q7TQT8 317 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 H2-M10.4Q85ZW8 331 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ifitm2Q99J93 144 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 V1ra8Q9EQ48 279 aa14.57□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 LtaP09225 202 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 S100a8P27005 89 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm5148Q8BGG2 154 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem129Q8K304 362 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gatad1Q920S3 266 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Necap2Q9D1J1 266 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ifitm5O88728 134 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Immp2lQ8BPT6 175 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Siglec15A7E1W8 342 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 LipiF6YQT7 476 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tnfrsf9P20334 256 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21394Q497R7 227 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prelid3aQ8VE85 172 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fmc1Q9CR13 113 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr223Q8VF69 319 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa14.56□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm36368A0A1D5RLK8 91 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ly6g6fB2RXM6 300 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm19345G3UYD9 124 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr322Q5NCC8 327 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Wbp2nlQ9D529 359 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Atg2bQ80XK6 2075 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tsc2Q61037 1814 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pglyrp3A1A547 347 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 P18532 116 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gng5Q80SZ7 68 aa14.55□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 NgfP01139 241 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Oosp2Q4FZG8 168 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cd200r1lQ6XJV6 249 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dock6Q8VDR9 2080 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21913J3KML9 361 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21776J3QPJ5 361 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 P01657 111 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Psg18B2RSG7 476 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Wipf3P0C7L0 485 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Efna2P52801 209 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 NrepQ07475 68 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm4881A0A140LIR9 352 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc35d2Q762D5 326 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Q8BG31 207 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc25a28Q8R0Z5 364 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Siglec12Q91Y57 467 aa14.54□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm28372A0A087WNV0 220 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trav12d-1A0N8R0 115 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fgf5P15656 264 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hyls1Q9CXX0 307 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa14.53□□□□□ -0.08
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 100.5 ms