Protein–RNA interactions for Protein: Q61010

Dtx1, E3 ubiquitin-protein ligase DTX1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx1Q61010 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Dtx1Q61010 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dtx1Q61010 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Dtx1Q61010 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Dtx1Q61010 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Dtx1Q61010 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Dtx1Q61010 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dtx1Q61010 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dtx1Q61010 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dtx1Q61010 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dtx1Q61010 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dtx1Q61010 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Dtx1Q61010 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dtx1Q61010 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dtx1Q61010 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dtx1Q61010 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Dtx1Q61010 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dtx1Q61010 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dtx1Q61010 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dtx1Q61010 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dtx1Q61010 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Dtx1Q61010 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dtx1Q61010 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dtx1Q61010 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dtx1Q61010 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dtx1Q61010 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dtx1Q61010 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dtx1Q61010 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dtx1Q61010 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dtx1Q61010 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Dtx1Q61010 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dtx1Q61010 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dtx1Q61010 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dtx1Q61010 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dtx1Q61010 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Dtx1Q61010 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Dtx1Q61010 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dtx1Q61010 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dtx1Q61010 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dtx1Q61010 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dtx1Q61010 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dtx1Q61010 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dtx1Q61010 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dtx1Q61010 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dtx1Q61010 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dtx1Q61010 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dtx1Q61010 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dtx1Q61010 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dtx1Q61010 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dtx1Q61010 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dtx1Q61010 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dtx1Q61010 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dtx1Q61010 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dtx1Q61010 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dtx1Q61010 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dtx1Q61010 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dtx1Q61010 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dtx1Q61010 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dtx1Q61010 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dtx1Q61010 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dtx1Q61010 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dtx1Q61010 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dtx1Q61010 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dtx1Q61010 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dtx1Q61010 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dtx1Q61010 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dtx1Q61010 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dtx1Q61010 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dtx1Q61010 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dtx1Q61010 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dtx1Q61010 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dtx1Q61010 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dtx1Q61010 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dtx1Q61010 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dtx1Q61010 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dtx1Q61010 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dtx1Q61010 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dtx1Q61010 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dtx1Q61010 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dtx1Q61010 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dtx1Q61010 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dtx1Q61010 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dtx1Q61010 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dtx1Q61010 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dtx1Q61010 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dtx1Q61010 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dtx1Q61010 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dtx1Q61010 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dtx1Q61010 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dtx1Q61010 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dtx1Q61010 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dtx1Q61010 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dtx1Q61010 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dtx1Q61010 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dtx1Q61010 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dtx1Q61010 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dtx1Q61010 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dtx1Q61010 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dtx1Q61010 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dtx1Q61010 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms