Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SftpcP21841 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SftpcP21841 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SftpcP21841 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SftpcP21841 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SftpcP21841 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SftpcP21841 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SftpcP21841 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SftpcP21841 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SftpcP21841 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SftpcP21841 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SftpcP21841 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SftpcP21841 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SftpcP21841 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SftpcP21841 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SftpcP21841 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SftpcP21841 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SftpcP21841 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SftpcP21841 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SftpcP21841 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SftpcP21841 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SftpcP21841 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SftpcP21841 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SftpcP21841 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SftpcP21841 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SftpcP21841 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SftpcP21841 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SftpcP21841 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SftpcP21841 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SftpcP21841 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SftpcP21841 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SftpcP21841 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SftpcP21841 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SftpcP21841 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SftpcP21841 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SftpcP21841 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SftpcP21841 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SftpcP21841 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SftpcP21841 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SftpcP21841 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SftpcP21841 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SftpcP21841 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SftpcP21841 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SftpcP21841 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SftpcP21841 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SftpcP21841 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SftpcP21841 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SftpcP21841 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SftpcP21841 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SftpcP21841 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SftpcP21841 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SftpcP21841 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SftpcP21841 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SftpcP21841 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SftpcP21841 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SftpcP21841 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SftpcP21841 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SftpcP21841 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SftpcP21841 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SftpcP21841 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SftpcP21841 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SftpcP21841 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SftpcP21841 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SftpcP21841 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SftpcP21841 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SftpcP21841 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SftpcP21841 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SftpcP21841 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SftpcP21841 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SftpcP21841 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SftpcP21841 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SftpcP21841 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SftpcP21841 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SftpcP21841 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SftpcP21841 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SftpcP21841 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SftpcP21841 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SftpcP21841 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SftpcP21841 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SftpcP21841 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SftpcP21841 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SftpcP21841 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SftpcP21841 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SftpcP21841 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SftpcP21841 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SftpcP21841 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SftpcP21841 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SftpcP21841 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SftpcP21841 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SftpcP21841 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SftpcP21841 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SftpcP21841 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SftpcP21841 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SftpcP21841 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SftpcP21841 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SftpcP21841 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SftpcP21841 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SftpcP21841 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SftpcP21841 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SftpcP21841 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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