Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Shisa3Q3UPR0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Shisa3Q3UPR0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Shisa3Q3UPR0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Shisa3Q3UPR0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Shisa3Q3UPR0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Shisa3Q3UPR0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Shisa3Q3UPR0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Shisa3Q3UPR0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Shisa3Q3UPR0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Shisa3Q3UPR0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Shisa3Q3UPR0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Shisa3Q3UPR0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Shisa3Q3UPR0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Shisa3Q3UPR0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Shisa3Q3UPR0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Shisa3Q3UPR0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Shisa3Q3UPR0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Shisa3Q3UPR0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Shisa3Q3UPR0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Shisa3Q3UPR0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Shisa3Q3UPR0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Shisa3Q3UPR0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Shisa3Q3UPR0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Shisa3Q3UPR0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Shisa3Q3UPR0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Shisa3Q3UPR0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Shisa3Q3UPR0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Shisa3Q3UPR0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Shisa3Q3UPR0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Shisa3Q3UPR0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Shisa3Q3UPR0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Shisa3Q3UPR0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Shisa3Q3UPR0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Shisa3Q3UPR0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Shisa3Q3UPR0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Shisa3Q3UPR0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Shisa3Q3UPR0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Shisa3Q3UPR0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Shisa3Q3UPR0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Shisa3Q3UPR0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Shisa3Q3UPR0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Shisa3Q3UPR0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Shisa3Q3UPR0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Shisa3Q3UPR0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Shisa3Q3UPR0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Shisa3Q3UPR0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Shisa3Q3UPR0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Shisa3Q3UPR0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Shisa3Q3UPR0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Shisa3Q3UPR0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Shisa3Q3UPR0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Shisa3Q3UPR0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Shisa3Q3UPR0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Shisa3Q3UPR0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Shisa3Q3UPR0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Shisa3Q3UPR0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Shisa3Q3UPR0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Shisa3Q3UPR0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Shisa3Q3UPR0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Shisa3Q3UPR0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Shisa3Q3UPR0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Shisa3Q3UPR0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Shisa3Q3UPR0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Shisa3Q3UPR0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Shisa3Q3UPR0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Shisa3Q3UPR0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Shisa3Q3UPR0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Shisa3Q3UPR0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Shisa3Q3UPR0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Shisa3Q3UPR0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Shisa3Q3UPR0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Shisa3Q3UPR0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Shisa3Q3UPR0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Shisa3Q3UPR0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Shisa3Q3UPR0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Shisa3Q3UPR0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Shisa3Q3UPR0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Shisa3Q3UPR0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Shisa3Q3UPR0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Shisa3Q3UPR0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Shisa3Q3UPR0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Shisa3Q3UPR0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Shisa3Q3UPR0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Shisa3Q3UPR0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Shisa3Q3UPR0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Shisa3Q3UPR0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Shisa3Q3UPR0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Shisa3Q3UPR0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Shisa3Q3UPR0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms