Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Shisa3Q3UPR0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shisa3Q3UPR0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shisa3Q3UPR0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Shisa3Q3UPR0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Shisa3Q3UPR0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Shisa3Q3UPR0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shisa3Q3UPR0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shisa3Q3UPR0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shisa3Q3UPR0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shisa3Q3UPR0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shisa3Q3UPR0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shisa3Q3UPR0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Shisa3Q3UPR0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shisa3Q3UPR0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shisa3Q3UPR0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Shisa3Q3UPR0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shisa3Q3UPR0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shisa3Q3UPR0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shisa3Q3UPR0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Shisa3Q3UPR0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shisa3Q3UPR0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Shisa3Q3UPR0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shisa3Q3UPR0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Shisa3Q3UPR0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shisa3Q3UPR0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shisa3Q3UPR0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shisa3Q3UPR0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shisa3Q3UPR0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Shisa3Q3UPR0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shisa3Q3UPR0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shisa3Q3UPR0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shisa3Q3UPR0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shisa3Q3UPR0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shisa3Q3UPR0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shisa3Q3UPR0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Shisa3Q3UPR0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shisa3Q3UPR0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shisa3Q3UPR0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Shisa3Q3UPR0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shisa3Q3UPR0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shisa3Q3UPR0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shisa3Q3UPR0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shisa3Q3UPR0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Shisa3Q3UPR0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shisa3Q3UPR0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shisa3Q3UPR0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shisa3Q3UPR0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shisa3Q3UPR0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shisa3Q3UPR0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shisa3Q3UPR0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shisa3Q3UPR0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shisa3Q3UPR0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shisa3Q3UPR0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shisa3Q3UPR0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shisa3Q3UPR0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shisa3Q3UPR0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shisa3Q3UPR0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shisa3Q3UPR0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shisa3Q3UPR0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shisa3Q3UPR0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shisa3Q3UPR0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shisa3Q3UPR0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shisa3Q3UPR0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shisa3Q3UPR0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shisa3Q3UPR0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shisa3Q3UPR0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shisa3Q3UPR0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Shisa3Q3UPR0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shisa3Q3UPR0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shisa3Q3UPR0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shisa3Q3UPR0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Shisa3Q3UPR0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shisa3Q3UPR0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shisa3Q3UPR0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shisa3Q3UPR0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shisa3Q3UPR0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shisa3Q3UPR0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shisa3Q3UPR0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shisa3Q3UPR0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shisa3Q3UPR0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shisa3Q3UPR0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shisa3Q3UPR0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shisa3Q3UPR0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shisa3Q3UPR0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shisa3Q3UPR0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shisa3Q3UPR0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shisa3Q3UPR0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shisa3Q3UPR0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shisa3Q3UPR0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1260.7 ms