Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SellP18337 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SellP18337 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SellP18337 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SellP18337 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SellP18337 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SellP18337 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SellP18337 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SellP18337 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SellP18337 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SellP18337 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SellP18337 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SellP18337 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SellP18337 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SellP18337 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SellP18337 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SellP18337 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SellP18337 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SellP18337 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SellP18337 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SellP18337 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SellP18337 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SellP18337 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SellP18337 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SellP18337 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SellP18337 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SellP18337 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SellP18337 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SellP18337 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SellP18337 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SellP18337 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SellP18337 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SellP18337 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SellP18337 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SellP18337 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SellP18337 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SellP18337 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SellP18337 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SellP18337 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SellP18337 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SellP18337 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SellP18337 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SellP18337 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SellP18337 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SellP18337 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SellP18337 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SellP18337 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SellP18337 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SellP18337 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SellP18337 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SellP18337 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SellP18337 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SellP18337 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SellP18337 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SellP18337 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SellP18337 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SellP18337 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SellP18337 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SellP18337 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SellP18337 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SellP18337 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SellP18337 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SellP18337 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SellP18337 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SellP18337 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SellP18337 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SellP18337 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SellP18337 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SellP18337 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SellP18337 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SellP18337 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SellP18337 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SellP18337 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SellP18337 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SellP18337 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SellP18337 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SellP18337 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SellP18337 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SellP18337 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SellP18337 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SellP18337 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SellP18337 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SellP18337 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SellP18337 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SellP18337 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SellP18337 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SellP18337 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SellP18337 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SellP18337 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SellP18337 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SellP18337 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SellP18337 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SellP18337 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SellP18337 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SellP18337 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SellP18337 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SellP18337 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SellP18337 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SellP18337 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SellP18337 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms