Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
SellP18337 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
SellP18337 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
SellP18337 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
SellP18337 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
SellP18337 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
SellP18337 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
SellP18337 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
SellP18337 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
SellP18337 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
SellP18337 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
SellP18337 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
SellP18337 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
SellP18337 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
SellP18337 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
SellP18337 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
SellP18337 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
SellP18337 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
SellP18337 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
SellP18337 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
SellP18337 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
SellP18337 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
SellP18337 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
SellP18337 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
SellP18337 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SellP18337 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
SellP18337 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
SellP18337 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SellP18337 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SellP18337 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SellP18337 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
SellP18337 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
SellP18337 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
SellP18337 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
SellP18337 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
SellP18337 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
SellP18337 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
SellP18337 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
SellP18337 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
SellP18337 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
SellP18337 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
SellP18337 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
SellP18337 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
SellP18337 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
SellP18337 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
SellP18337 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
SellP18337 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
SellP18337 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
SellP18337 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
SellP18337 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,73■■□□□ 1,55
SellP18337 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
SellP18337 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
SellP18337 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
SellP18337 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
SellP18337 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
SellP18337 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
SellP18337 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
SellP18337 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,49■■□□□ 1,51
SellP18337 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
SellP18337 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
SellP18337 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,24■■□□□ 1,47
SellP18337 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
SellP18337 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
SellP18337 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,18■■□□□ 1,46
SellP18337 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
SellP18337 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,14■■□□□ 1,45
SellP18337 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
SellP18337 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
SellP18337 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
SellP18337 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
SellP18337 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,03■■□□□ 1,44
SellP18337 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
SellP18337 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
SellP18337 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,02■■□□□ 1,43
SellP18337 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
SellP18337 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,93■■□□□ 1,42
SellP18337 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
SellP18337 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,88■■□□□ 1,41
SellP18337 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
SellP18337 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
SellP18337 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
SellP18337 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
SellP18337 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
SellP18337 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
SellP18337 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
SellP18337 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,71■■□□□ 1,39
SellP18337 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
SellP18337 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
SellP18337 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
SellP18337 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
SellP18337 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
SellP18337 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
SellP18337 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
SellP18337 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
SellP18337 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
SellP18337 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
SellP18337 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
SellP18337 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
SellP18337 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
SellP18337 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,9 ms