Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Irf2bp2E9Q1P8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf2bp2E9Q1P8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf2bp2E9Q1P8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf2bp2E9Q1P8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf2bp2E9Q1P8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf2bp2E9Q1P8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf2bp2E9Q1P8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf2bp2E9Q1P8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf2bp2E9Q1P8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf2bp2E9Q1P8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf2bp2E9Q1P8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf2bp2E9Q1P8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf2bp2E9Q1P8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf2bp2E9Q1P8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf2bp2E9Q1P8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf2bp2E9Q1P8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf2bp2E9Q1P8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf2bp2E9Q1P8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf2bp2E9Q1P8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf2bp2E9Q1P8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf2bp2E9Q1P8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf2bp2E9Q1P8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf2bp2E9Q1P8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf2bp2E9Q1P8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf2bp2E9Q1P8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf2bp2E9Q1P8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf2bp2E9Q1P8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf2bp2E9Q1P8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf2bp2E9Q1P8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf2bp2E9Q1P8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf2bp2E9Q1P8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf2bp2E9Q1P8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf2bp2E9Q1P8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf2bp2E9Q1P8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf2bp2E9Q1P8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf2bp2E9Q1P8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf2bp2E9Q1P8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf2bp2E9Q1P8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf2bp2E9Q1P8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf2bp2E9Q1P8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf2bp2E9Q1P8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf2bp2E9Q1P8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf2bp2E9Q1P8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf2bp2E9Q1P8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf2bp2E9Q1P8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf2bp2E9Q1P8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf2bp2E9Q1P8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf2bp2E9Q1P8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf2bp2E9Q1P8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf2bp2E9Q1P8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf2bp2E9Q1P8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf2bp2E9Q1P8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf2bp2E9Q1P8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf2bp2E9Q1P8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf2bp2E9Q1P8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf2bp2E9Q1P8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf2bp2E9Q1P8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf2bp2E9Q1P8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf2bp2E9Q1P8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf2bp2E9Q1P8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf2bp2E9Q1P8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf2bp2E9Q1P8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf2bp2E9Q1P8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf2bp2E9Q1P8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf2bp2E9Q1P8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf2bp2E9Q1P8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf2bp2E9Q1P8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf2bp2E9Q1P8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf2bp2E9Q1P8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf2bp2E9Q1P8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf2bp2E9Q1P8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf2bp2E9Q1P8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf2bp2E9Q1P8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf2bp2E9Q1P8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf2bp2E9Q1P8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf2bp2E9Q1P8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf2bp2E9Q1P8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf2bp2E9Q1P8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf2bp2E9Q1P8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf2bp2E9Q1P8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf2bp2E9Q1P8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf2bp2E9Q1P8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf2bp2E9Q1P8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf2bp2E9Q1P8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf2bp2E9Q1P8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf2bp2E9Q1P8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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