RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SYT8Q8NBV8 401 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SNAI2O43623 268 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 CIDEAO60543 219 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 TCL1AP56279 114 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 DEFA6Q01524 100 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 ZFP82Q8N141 532 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 X6R8D5 127 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GUT8 65 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 LYRM9A8MSI8 78 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 M0R2P5 195 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 GNRH2O43555 120 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 IGLC6P0CF74 106 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 CTRLP40313 264 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 RIGQ13278 110 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 RASL11AQ6T310 242 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 C9orf85Q96MD7 179 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 CNFNQ9BYD5 112 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 A6NJY4 79 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 HIGD1CA8MV81 97 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 H3BVH4 76 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 TRGC1P0CF51 173 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 RASL10AQ92737 203 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-220ENST00000550700 A8MWV9 139 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 NXPH4O95158 308 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 Q6ZQT7 251 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 Q8NAQ8 132 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 NUP35Q8NFH5 326 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 GTSF1Q8WW33 167 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 FRZBQ92765 325 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 C18orf15Q96N68 181 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 TPPP3Q9BW30 176 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 MDFICQ9P1T7 246 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 SPINK4O60575 86 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 SMIM17P0DL12 118 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 AZU1P20160 251 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 ZNF876PQ49A33 203 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 IL17DQ8TAD2 202 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 RHODO00212 210 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 GZMBP10144 247 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 HBBP68871 147 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 TWIST1Q15672 202 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 ZNF575Q86XF7 245 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 AP1S3Q96PC3 154 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 MUC4Q99102 2169 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 M0R381 172 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 MT-ND6P03923 174 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 NTF3P20783 257 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 SLAQ13239 276 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 DKK2Q9UBU2 259 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 EMP1P54849 157 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 DAD1P61803 113 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 ELOBQ15370 118 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GXF2 115 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-220ENST00000550700 H7C1H1 209 aa6.66□□□□□ -1.34
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