RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552433.1

LETMD1-233, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 2

Gene LETMD1, Length 727 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-233	ENST00000552433	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	MYLK	Q15746	1914 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	GNGT2	O14610	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	IL5	P05113	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CSN1S1	P47710	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CCL20	P78556	96 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	SI	P14410	1827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433		A8MWL6	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433		K7EQD1	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	PLA2G10	O15496	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CXCL1	P09341	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433		V9GYH0	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A0D9SEW6	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	LTA	P01374	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	HBD	P02042	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CBLN1	P23435	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	COL8A2	P25067	703 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	AQP1	P29972	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	DAP	P51397	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	DYNLT3	P51808	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF136	P52737	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CCL14	Q16627	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ATOX1	O00244	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	LITAF	Q99732	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-233	ENST00000552433	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	HCFC1	P51610	2035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433		C9JCJ5	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	MGST2	Q99735	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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