RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 FABP4P15090 132 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFA6P56556 154 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 FXYD4P59646 89 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 TOMM20LQ6UXN7 152 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 OR4B1Q8NGF8 309 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 OR4C12Q96R67 309 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 EFCAB11Q9BUY7 163 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 MED31Q9Y3C7 131 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 USP54Q70EL1 1684 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 CITO14578 2027 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 BCL9O00512 1426 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A0J9YY99 117 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 C5orf58C9J3I9 102 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM107AO95990 144 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 IFNA21P01568 189 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 FABP2P12104 132 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 SDC2P34741 201 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 B2MP61769 119 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 Q6ZQY7 126 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 PRELID3AQ96N28 172 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 AP1S3Q96PC3 154 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 COL6A3P12111 3177 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 TET1Q8NFU7 2136 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM135BQ49AJ0 1406 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD3E-201ENST00000362899 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 A6NN06 94 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 RPL7P18124 248 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SPINK7P58062 85 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00305Q7Z4B0 112 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 OR5H6Q8NGV6 325 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 DLC1Q96QB1 1528 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 PTPN13Q12923 2485 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NUPR2A6NF83 97 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 K7EIL1 84 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SULT1C4O75897 302 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TRACP01848 142 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CD14P08571 375 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 PDE6GP18545 87 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF137PP52743 207 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 MAXP61244 160 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 IZUMO2Q6UXV1 221 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 C10orf111Q8N326 155 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 MORN4Q8NDC4 146 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 OR5AK2Q8NH90 309 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CLEC2BQ92478 149 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 LXNQ9BS40 222 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 LIMD2Q9BT23 127 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CBLN4Q9NTU7 201 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC28Q96AY4 2481 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 FANCMQ8IYD8 2048 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NCOR1O75376 2440 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 MAST4O15021 2626 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 H3BMG7 143 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 IGHV3-30P01768 117 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NBEAP1P0C6P0 100 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TPT1P13693 172 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SPINT3P49223 89 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SRP9P49458 86 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 LSM3P62310 102 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 C6orf52Q5T4I8 152 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CASC2Q6XLA1 102 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SMIM15Q7Z3B0 74 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 Q86TA4 180 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TEX29Q8N6K0 151 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NAT14Q8WUY8 206 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC115Q96NT0 180 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NABP2Q9BQ15 211 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SELENOSQ9BQE4 189 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFAF1Q9Y375 327 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR97A6NE52 1622 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 UBR4Q5T4S7 5183 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 APCP25054 2843 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 A2MP01023 1474 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 ARAP1Q96P48 1450 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD3E-201ENST00000362899 BBIP1A8MTZ0 92 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.8 ms