RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa10.51□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01728 117 aa10.51□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3U1D9 316 aa10.51□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pom121l2Q5SW25 972 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hes7Q8BKT2 225 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8C708 225 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StradbQ8K4T3 418 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Poldip2Q91VA6 368 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ykt6Q9CQW1 198 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crim1Q9JLL0 1037 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20877J3QPZ4 227 aa10.5□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf21O35437 179 aa10.5□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxxc4Q6NXI8 198 aa10.5□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klrd1O54707 179 aa10.49□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx19Q99ME7 446 aa10.49□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9130204L05RikG3UWB8 92 aa10.49□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss45Q8K4I7 317 aa10.49□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pfn1P62962 140 aa10.49□□□□□ -0.73
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2ry6Q9ERK9 328 aa10.49□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egr4Q9WUF2 478 aa10.49□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St6galnac3Q9WUV2 305 aa10.49□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl2l10Q9Z0F3 191 aa10.49□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa10.48□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itpr3P70227 2670 aa10.48□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbv12-2A0A0B4J1H1 124 aa10.48□□□□□ -0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr465-ps1A0A0U1RPZ4 315 aa10.48□□□□□ -0.73
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