Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Psmb6Q60692 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Psmb6Q60692 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psmb6Q60692 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psmb6Q60692 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psmb6Q60692 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmb6Q60692 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmb6Q60692 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmb6Q60692 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmb6Q60692 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmb6Q60692 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmb6Q60692 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmb6Q60692 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmb6Q60692 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmb6Q60692 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmb6Q60692 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmb6Q60692 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmb6Q60692 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmb6Q60692 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmb6Q60692 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmb6Q60692 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmb6Q60692 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmb6Q60692 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmb6Q60692 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmb6Q60692 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmb6Q60692 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb6Q60692 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmb6Q60692 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmb6Q60692 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmb6Q60692 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmb6Q60692 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmb6Q60692 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmb6Q60692 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmb6Q60692 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmb6Q60692 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmb6Q60692 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmb6Q60692 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmb6Q60692 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmb6Q60692 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmb6Q60692 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmb6Q60692 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmb6Q60692 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb6Q60692 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb6Q60692 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb6Q60692 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb6Q60692 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb6Q60692 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb6Q60692 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb6Q60692 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb6Q60692 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmb6Q60692 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb6Q60692 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb6Q60692 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb6Q60692 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmb6Q60692 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmb6Q60692 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmb6Q60692 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmb6Q60692 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmb6Q60692 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmb6Q60692 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmb6Q60692 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmb6Q60692 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmb6Q60692 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmb6Q60692 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmb6Q60692 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb6Q60692 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb6Q60692 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmb6Q60692 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmb6Q60692 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmb6Q60692 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb6Q60692 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmb6Q60692 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb6Q60692 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb6Q60692 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb6Q60692 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb6Q60692 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb6Q60692 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb6Q60692 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb6Q60692 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb6Q60692 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb6Q60692 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb6Q60692 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmb6Q60692 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb6Q60692 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb6Q60692 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb6Q60692 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb6Q60692 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb6Q60692 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmb6Q60692 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb6Q60692 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb6Q60692 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmb6Q60692 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmb6Q60692 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms