Protein–RNA interactions for Protein: P32442

Meox1, Homeobox protein MOX-1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meox1P32442 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Meox1P32442 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Meox1P32442 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Meox1P32442 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Meox1P32442 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Meox1P32442 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Meox1P32442 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Meox1P32442 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Meox1P32442 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Meox1P32442 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Meox1P32442 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Meox1P32442 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meox1P32442 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Meox1P32442 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Meox1P32442 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Meox1P32442 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Meox1P32442 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Meox1P32442 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meox1P32442 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Meox1P32442 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meox1P32442 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Meox1P32442 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Meox1P32442 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meox1P32442 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meox1P32442 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Meox1P32442 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Meox1P32442 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Meox1P32442 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Meox1P32442 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Meox1P32442 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Meox1P32442 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Meox1P32442 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meox1P32442 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Meox1P32442 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meox1P32442 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Meox1P32442 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Meox1P32442 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meox1P32442 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Meox1P32442 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Meox1P32442 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meox1P32442 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Meox1P32442 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meox1P32442 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meox1P32442 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meox1P32442 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meox1P32442 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Meox1P32442 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Meox1P32442 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meox1P32442 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Meox1P32442 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Meox1P32442 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meox1P32442 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meox1P32442 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meox1P32442 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meox1P32442 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meox1P32442 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meox1P32442 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Meox1P32442 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meox1P32442 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Meox1P32442 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meox1P32442 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meox1P32442 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meox1P32442 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meox1P32442 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meox1P32442 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meox1P32442 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meox1P32442 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meox1P32442 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meox1P32442 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meox1P32442 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meox1P32442 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meox1P32442 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meox1P32442 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meox1P32442 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meox1P32442 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meox1P32442 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meox1P32442 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meox1P32442 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meox1P32442 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Meox1P32442 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Meox1P32442 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Meox1P32442 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Meox1P32442 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Meox1P32442 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Meox1P32442 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meox1P32442 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meox1P32442 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meox1P32442 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meox1P32442 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meox1P32442 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meox1P32442 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meox1P32442 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Meox1P32442 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meox1P32442 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meox1P32442 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meox1P32442 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meox1P32442 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Meox1P32442 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Meox1P32442 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Meox1P32442 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms