Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
StomP54116 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
StomP54116 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
StomP54116 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
StomP54116 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
StomP54116 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
StomP54116 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
StomP54116 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
StomP54116 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
StomP54116 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
StomP54116 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
StomP54116 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
StomP54116 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
StomP54116 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
StomP54116 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
StomP54116 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
StomP54116 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
StomP54116 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
StomP54116 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
StomP54116 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
StomP54116 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
StomP54116 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
StomP54116 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
StomP54116 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
StomP54116 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
StomP54116 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
StomP54116 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
StomP54116 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
StomP54116 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
StomP54116 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
StomP54116 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
StomP54116 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
StomP54116 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
StomP54116 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
StomP54116 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StomP54116 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
StomP54116 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
StomP54116 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
StomP54116 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
StomP54116 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
StomP54116 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
StomP54116 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StomP54116 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
StomP54116 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
StomP54116 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
StomP54116 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
StomP54116 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
StomP54116 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
StomP54116 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
StomP54116 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
StomP54116 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
StomP54116 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
StomP54116 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
StomP54116 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
StomP54116 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
StomP54116 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
StomP54116 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
StomP54116 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
StomP54116 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
StomP54116 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
StomP54116 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
StomP54116 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StomP54116 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
StomP54116 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
StomP54116 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
StomP54116 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
StomP54116 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
StomP54116 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
StomP54116 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
StomP54116 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StomP54116 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
StomP54116 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
StomP54116 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
StomP54116 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
StomP54116 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
StomP54116 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
StomP54116 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
StomP54116 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
StomP54116 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
StomP54116 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
StomP54116 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
StomP54116 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
StomP54116 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StomP54116 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StomP54116 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
StomP54116 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
StomP54116 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
StomP54116 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StomP54116 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StomP54116 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
StomP54116 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
StomP54116 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
StomP54116 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
StomP54116 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
StomP54116 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StomP54116 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
StomP54116 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StomP54116 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
StomP54116 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StomP54116 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms