Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab4aP56371 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab4aP56371 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab4aP56371 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab4aP56371 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab4aP56371 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab4aP56371 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab4aP56371 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab4aP56371 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab4aP56371 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab4aP56371 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab4aP56371 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab4aP56371 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab4aP56371 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab4aP56371 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab4aP56371 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab4aP56371 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab4aP56371 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab4aP56371 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab4aP56371 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab4aP56371 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab4aP56371 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab4aP56371 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab4aP56371 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab4aP56371 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab4aP56371 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab4aP56371 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab4aP56371 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab4aP56371 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab4aP56371 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab4aP56371 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab4aP56371 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab4aP56371 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab4aP56371 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab4aP56371 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab4aP56371 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab4aP56371 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab4aP56371 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab4aP56371 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab4aP56371 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab4aP56371 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab4aP56371 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab4aP56371 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab4aP56371 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab4aP56371 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab4aP56371 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab4aP56371 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab4aP56371 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab4aP56371 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab4aP56371 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab4aP56371 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab4aP56371 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab4aP56371 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab4aP56371 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab4aP56371 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab4aP56371 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab4aP56371 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab4aP56371 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab4aP56371 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab4aP56371 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab4aP56371 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab4aP56371 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab4aP56371 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab4aP56371 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab4aP56371 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab4aP56371 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab4aP56371 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab4aP56371 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab4aP56371 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab4aP56371 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab4aP56371 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab4aP56371 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab4aP56371 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab4aP56371 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab4aP56371 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab4aP56371 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab4aP56371 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab4aP56371 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab4aP56371 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab4aP56371 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab4aP56371 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab4aP56371 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab4aP56371 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab4aP56371 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab4aP56371 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab4aP56371 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab4aP56371 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab4aP56371 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab4aP56371 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab4aP56371 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab4aP56371 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab4aP56371 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab4aP56371 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab4aP56371 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab4aP56371 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab4aP56371 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab4aP56371 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab4aP56371 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab4aP56371 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab4aP56371 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms