Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Rab4aP56371 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rab4aP56371 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Rab4aP56371 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rab4aP56371 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rab4aP56371 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Rab4aP56371 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Rab4aP56371 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Rab4aP56371 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Rab4aP56371 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Rab4aP56371 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Rab4aP56371 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Rab4aP56371 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Rab4aP56371 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rab4aP56371 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rab4aP56371 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Rab4aP56371 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Rab4aP56371 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Rab4aP56371 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Rab4aP56371 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rab4aP56371 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rab4aP56371 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Rab4aP56371 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Rab4aP56371 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rab4aP56371 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Rab4aP56371 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Rab4aP56371 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Rab4aP56371 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Rab4aP56371 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Rab4aP56371 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Rab4aP56371 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Rab4aP56371 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Rab4aP56371 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Rab4aP56371 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Rab4aP56371 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Rab4aP56371 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Rab4aP56371 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Rab4aP56371 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Rab4aP56371 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Rab4aP56371 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Rab4aP56371 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,38■■□□□ 1,17
Rab4aP56371 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Rab4aP56371 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Rab4aP56371 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Rab4aP56371 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Rab4aP56371 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Rab4aP56371 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Rab4aP56371 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Rab4aP56371 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Rab4aP56371 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Rab4aP56371 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Rab4aP56371 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Rab4aP56371 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,05■■□□□ 1,12
Rab4aP56371 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Rab4aP56371 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Rab4aP56371 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Rab4aP56371 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Rab4aP56371 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Rab4aP56371 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Rab4aP56371 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Rab4aP56371 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Rab4aP56371 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Rab4aP56371 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Rab4aP56371 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Rab4aP56371 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Rab4aP56371 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
Rab4aP56371 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Rab4aP56371 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Rab4aP56371 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Rab4aP56371 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Rab4aP56371 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab4aP56371 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,64■■□□□ 1,06
Rab4aP56371 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab4aP56371 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab4aP56371 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab4aP56371 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab4aP56371 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab4aP56371 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab4aP56371 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Rab4aP56371 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab4aP56371 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab4aP56371 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab4aP56371 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab4aP56371 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab4aP56371 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab4aP56371 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rab4aP56371 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rab4aP56371 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab4aP56371 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab4aP56371 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab4aP56371 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab4aP56371 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Rab4aP56371 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rab4aP56371 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab4aP56371 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab4aP56371 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab4aP56371 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Rab4aP56371 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Rab4aP56371 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Rab4aP56371 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
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