Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
SdcbpO08992 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
SdcbpO08992 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
SdcbpO08992 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
SdcbpO08992 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
SdcbpO08992 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
SdcbpO08992 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
SdcbpO08992 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
SdcbpO08992 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
SdcbpO08992 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
SdcbpO08992 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
SdcbpO08992 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
SdcbpO08992 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
SdcbpO08992 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
SdcbpO08992 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
SdcbpO08992 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SdcbpO08992 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
SdcbpO08992 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SdcbpO08992 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
SdcbpO08992 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SdcbpO08992 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SdcbpO08992 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
SdcbpO08992 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
SdcbpO08992 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
SdcbpO08992 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
SdcbpO08992 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
SdcbpO08992 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SdcbpO08992 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
SdcbpO08992 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
SdcbpO08992 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
SdcbpO08992 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
SdcbpO08992 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
SdcbpO08992 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
SdcbpO08992 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
SdcbpO08992 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
SdcbpO08992 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
SdcbpO08992 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
SdcbpO08992 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
SdcbpO08992 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
SdcbpO08992 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
SdcbpO08992 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
SdcbpO08992 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
SdcbpO08992 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
SdcbpO08992 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
SdcbpO08992 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
SdcbpO08992 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
SdcbpO08992 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
SdcbpO08992 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
SdcbpO08992 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
SdcbpO08992 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,25■■□□□ 1,47
SdcbpO08992 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
SdcbpO08992 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,09■■□□□ 1,45
SdcbpO08992 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
SdcbpO08992 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
SdcbpO08992 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
SdcbpO08992 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
SdcbpO08992 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
SdcbpO08992 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
SdcbpO08992 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
SdcbpO08992 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
SdcbpO08992 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
SdcbpO08992 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
SdcbpO08992 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,84■■□□□ 1,41
SdcbpO08992 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
SdcbpO08992 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
SdcbpO08992 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
SdcbpO08992 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
SdcbpO08992 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
SdcbpO08992 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
SdcbpO08992 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,76■■□□□ 1,39
SdcbpO08992 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
SdcbpO08992 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
SdcbpO08992 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
SdcbpO08992 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
SdcbpO08992 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
SdcbpO08992 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,57■■□□□ 1,36
SdcbpO08992 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
SdcbpO08992 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
SdcbpO08992 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,35
SdcbpO08992 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
SdcbpO08992 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
SdcbpO08992 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
SdcbpO08992 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
SdcbpO08992 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,38■■□□□ 1,33
SdcbpO08992 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
SdcbpO08992 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
SdcbpO08992 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
SdcbpO08992 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
SdcbpO08992 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
SdcbpO08992 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
SdcbpO08992 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
SdcbpO08992 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
SdcbpO08992 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
SdcbpO08992 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
SdcbpO08992 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
SdcbpO08992 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
SdcbpO08992 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,17■■□□□ 1,3
SdcbpO08992 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
SdcbpO08992 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
SdcbpO08992 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
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