Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Gabra2P26048 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gabra2P26048 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gabra2P26048 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gabra2P26048 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gabra2P26048 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabra2P26048 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gabra2P26048 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gabra2P26048 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gabra2P26048 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gabra2P26048 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gabra2P26048 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gabra2P26048 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gabra2P26048 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabra2P26048 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gabra2P26048 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabra2P26048 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabra2P26048 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabra2P26048 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gabra2P26048 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gabra2P26048 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gabra2P26048 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gabra2P26048 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gabra2P26048 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabra2P26048 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gabra2P26048 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabra2P26048 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gabra2P26048 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gabra2P26048 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabra2P26048 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gabra2P26048 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabra2P26048 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gabra2P26048 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gabra2P26048 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gabra2P26048 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabra2P26048 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabra2P26048 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabra2P26048 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabra2P26048 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabra2P26048 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra2P26048 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabra2P26048 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabra2P26048 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabra2P26048 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabra2P26048 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabra2P26048 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabra2P26048 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabra2P26048 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabra2P26048 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabra2P26048 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabra2P26048 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabra2P26048 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabra2P26048 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabra2P26048 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra2P26048 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabra2P26048 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabra2P26048 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gabra2P26048 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gabra2P26048 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabra2P26048 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabra2P26048 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gabra2P26048 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabra2P26048 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabra2P26048 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabra2P26048 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gabra2P26048 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabra2P26048 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabra2P26048 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabra2P26048 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabra2P26048 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabra2P26048 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabra2P26048 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabra2P26048 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra2P26048 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra2P26048 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra2P26048 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabra2P26048 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabra2P26048 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gabra2P26048 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabra2P26048 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabra2P26048 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra2P26048 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabra2P26048 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabra2P26048 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabra2P26048 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra2P26048 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra2P26048 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabra2P26048 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabra2P26048 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabra2P26048 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra2P26048 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra2P26048 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabra2P26048 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra2P26048 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gabra2P26048 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabra2P26048 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabra2P26048 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabra2P26048 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabra2P26048 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra2P26048 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms