Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms