Protein–RNA interactions for Protein: P41133

Id3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Id3P41133 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Id3P41133 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Id3P41133 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Id3P41133 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Id3P41133 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Id3P41133 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Id3P41133 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Id3P41133 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Id3P41133 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Id3P41133 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Id3P41133 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Id3P41133 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Id3P41133 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Id3P41133 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Id3P41133 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Id3P41133 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Id3P41133 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Id3P41133 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Id3P41133 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Id3P41133 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Id3P41133 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Id3P41133 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Id3P41133 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Id3P41133 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Id3P41133 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Id3P41133 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Id3P41133 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Id3P41133 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Id3P41133 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Id3P41133 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Id3P41133 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Id3P41133 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Id3P41133 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Id3P41133 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Id3P41133 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Id3P41133 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Id3P41133 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Id3P41133 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Id3P41133 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Id3P41133 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Id3P41133 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Id3P41133 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Id3P41133 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Id3P41133 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Id3P41133 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Id3P41133 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Id3P41133 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Id3P41133 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Id3P41133 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Id3P41133 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Id3P41133 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Id3P41133 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Id3P41133 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Id3P41133 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Id3P41133 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Id3P41133 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Id3P41133 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Id3P41133 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Id3P41133 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Id3P41133 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Id3P41133 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Id3P41133 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Id3P41133 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Id3P41133 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Id3P41133 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Id3P41133 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Id3P41133 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Id3P41133 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Id3P41133 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Id3P41133 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Id3P41133 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Id3P41133 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Id3P41133 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Id3P41133 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Id3P41133 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Id3P41133 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Id3P41133 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Id3P41133 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Id3P41133 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Id3P41133 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Id3P41133 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Id3P41133 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Id3P41133 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Id3P41133 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Id3P41133 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Id3P41133 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Id3P41133 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Id3P41133 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Id3P41133 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Id3P41133 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Id3P41133 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Id3P41133 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Id3P41133 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Id3P41133 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Id3P41133 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Id3P41133 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Id3P41133 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Id3P41133 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Id3P41133 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Id3P41133 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms