RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm11756A2BEJ1 356 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dbx2F8VQH7 377 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm20830J3KML6 227 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rgs5O08850 181 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cited2O35740 269 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gpr33O88416 339 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hbb-bh0P04443 147 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 VhlP40338 181 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lyg2Q3V1I0 213 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm10188Q3V432 135 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wipf2Q6PEV3 440 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Golt1aQ9DCQ3 133 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mixl1Q9WUI0 231 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp980A2A9J5 645 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm6526G3X9Q9 198 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rnf5O35445 180 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bpifa2P07743 235 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Siah2Q06986 325 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp974Q3UVF6 752 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Npy4rQ61041 375 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Iba57Q8CAK1 358 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc22a26Q91WJ2 552 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ap5s1Q9D742 170 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myoz1Q9JK37 296 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bhlha15Q9QYC3 197 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ighv5-17A0A075B5R1 117 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem29A2ANF5 204 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Srp14P16254 110 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Oprk1P33534 380 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 BlcapP62951 87 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Reep5Q60870 185 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nupl2Q8CIC2 420 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1370Q8VFG4 316 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr790Q8VGJ3 322 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Insig2Q91WG1 225 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cyb5bQ9CQX2 146 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PigcQ9CXR4 297 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpl15Q9CZM2 204 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ovol1Q9WTJ2 267 aa14.79□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trav6d-3A0A075B6B3 112 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr746E9Q840 314 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rarres1F6ZIS7 283 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Btbd35f6J3QMW9 498 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankrd66J3QNN4 192 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr191L7N1Z8 309 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hoxb5P09079 269 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gon7P0C8B4 98 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trav6-3Q5R1E6 112 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nmes1Q810Q5 83 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 9230109A22RikQ8BHE6 111 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 B3gnt9Q8VI16 399 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab29Q91YQ1 204 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mrpl3Q99N95 348 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab32Q9CZE3 223 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HpgdsQ9JHF7 199 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm21974F6W3F3 119 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fabp9O08716 132 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hoxa1P09022 331 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Srsf2Q62093 221 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam122bQ6NZE7 255 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sys1Q78S06 156 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vma21Q78T54 101 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gemin8Q8BHE1 238 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Yipf6Q8BR70 236 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ercc8Q8CFD5 397 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc20Q8CI70 184 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr495Q8VF12 330 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HaghQ99KB8 309 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr632Q9EPN9 317 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pus1Q9WU56 423 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Setd2E9Q5F9 2537 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 4933408B17RikG3X9B4 273 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm20821J3QPJ2 227 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Defa14P50712 85 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ubald1Q6P3B2 176 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1225Q7TR01 311 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ifna12Q80SS5 189 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vstm2aQ8R0A6 236 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr794Q8VF26 320 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ms4a6dQ99N07 247 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp6v0e1Q9CQD8 81 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccl24Q9JKC0 119 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm5493S4R2D1 92 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ighv1-13A0A075B5I0 98 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fcrl6A1YIY0 268 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 H60bB1B212 251 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr905L7N1X5 310 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 BC117090L7N257 96 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GbaP17439 515 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hist1h1aP43275 213 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpl8P62918 257 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cd52Q64389 74 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr688Q6W049 321 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rsl1Q7M6Y1 485 aa14.76□□□□□ -0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms