Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Rab29Q91YQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Rab29Q91YQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rab29Q91YQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rab29Q91YQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Rab29Q91YQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rab29Q91YQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rab29Q91YQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rab29Q91YQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rab29Q91YQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rab29Q91YQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Rab29Q91YQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rab29Q91YQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rab29Q91YQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rab29Q91YQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Rab29Q91YQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Rab29Q91YQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rab29Q91YQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Rab29Q91YQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rab29Q91YQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rab29Q91YQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Rab29Q91YQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Rab29Q91YQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rab29Q91YQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Rab29Q91YQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Rab29Q91YQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Rab29Q91YQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Rab29Q91YQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Rab29Q91YQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Rab29Q91YQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Rab29Q91YQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Rab29Q91YQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Rab29Q91YQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Rab29Q91YQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Rab29Q91YQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
Rab29Q91YQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Rab29Q91YQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Rab29Q91YQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Rab29Q91YQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Rab29Q91YQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Rab29Q91YQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Rab29Q91YQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Rab29Q91YQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rab29Q91YQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Rab29Q91YQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Rab29Q91YQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rab29Q91YQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rab29Q91YQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rab29Q91YQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Rab29Q91YQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Rab29Q91YQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rab29Q91YQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rab29Q91YQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Rab29Q91YQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Rab29Q91YQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rab29Q91YQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Rab29Q91YQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Rab29Q91YQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Rab29Q91YQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Rab29Q91YQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Rab29Q91YQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rab29Q91YQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Rab29Q91YQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Rab29Q91YQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Rab29Q91YQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Rab29Q91YQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Rab29Q91YQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Rab29Q91YQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Rab29Q91YQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Rab29Q91YQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Rab29Q91YQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Rab29Q91YQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Rab29Q91YQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Rab29Q91YQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Rab29Q91YQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Rab29Q91YQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Rab29Q91YQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Rab29Q91YQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Rab29Q91YQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Rab29Q91YQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Rab29Q91YQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Rab29Q91YQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Rab29Q91YQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Rab29Q91YQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Rab29Q91YQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Rab29Q91YQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Rab29Q91YQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Rab29Q91YQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Rab29Q91YQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Rab29Q91YQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Rab29Q91YQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Rab29Q91YQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Rab29Q91YQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Rab29Q91YQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Rab29Q91YQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Rab29Q91YQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Rab29Q91YQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Rab29Q91YQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Rab29Q91YQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Rab29Q91YQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
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