Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I0

Ighv1-13, Immunoglobulin heavy variable V1-13, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-13A0A075B5I0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Ighv1-13A0A075B5I0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ighv1-13A0A075B5I0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ighv1-13A0A075B5I0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ighv1-13A0A075B5I0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Ighv1-13A0A075B5I0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Ighv1-13A0A075B5I0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ighv1-13A0A075B5I0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ighv1-13A0A075B5I0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ighv1-13A0A075B5I0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ighv1-13A0A075B5I0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ighv1-13A0A075B5I0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ighv1-13A0A075B5I0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ighv1-13A0A075B5I0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ighv1-13A0A075B5I0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ighv1-13A0A075B5I0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ighv1-13A0A075B5I0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ighv1-13A0A075B5I0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ighv1-13A0A075B5I0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Ighv1-13A0A075B5I0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ighv1-13A0A075B5I0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ighv1-13A0A075B5I0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ighv1-13A0A075B5I0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ighv1-13A0A075B5I0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ighv1-13A0A075B5I0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ighv1-13A0A075B5I0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ighv1-13A0A075B5I0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Ighv1-13A0A075B5I0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ighv1-13A0A075B5I0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Ighv1-13A0A075B5I0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ighv1-13A0A075B5I0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ighv1-13A0A075B5I0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ighv1-13A0A075B5I0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ighv1-13A0A075B5I0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ighv1-13A0A075B5I0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Ighv1-13A0A075B5I0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ighv1-13A0A075B5I0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ighv1-13A0A075B5I0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Ighv1-13A0A075B5I0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ighv1-13A0A075B5I0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ighv1-13A0A075B5I0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Ighv1-13A0A075B5I0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ighv1-13A0A075B5I0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ighv1-13A0A075B5I0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ighv1-13A0A075B5I0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ighv1-13A0A075B5I0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ighv1-13A0A075B5I0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Ighv1-13A0A075B5I0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ighv1-13A0A075B5I0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ighv1-13A0A075B5I0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Ighv1-13A0A075B5I0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ighv1-13A0A075B5I0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Ighv1-13A0A075B5I0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ighv1-13A0A075B5I0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ighv1-13A0A075B5I0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ighv1-13A0A075B5I0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ighv1-13A0A075B5I0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ighv1-13A0A075B5I0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Ighv1-13A0A075B5I0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ighv1-13A0A075B5I0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ighv1-13A0A075B5I0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ighv1-13A0A075B5I0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,43
Ighv1-13A0A075B5I0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ighv1-13A0A075B5I0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
Ighv1-13A0A075B5I0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ighv1-13A0A075B5I0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ighv1-13A0A075B5I0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Ighv1-13A0A075B5I0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Ighv1-13A0A075B5I0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ighv1-13A0A075B5I0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ighv1-13A0A075B5I0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ighv1-13A0A075B5I0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ighv1-13A0A075B5I0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ighv1-13A0A075B5I0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Ighv1-13A0A075B5I0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ighv1-13A0A075B5I0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ighv1-13A0A075B5I0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ighv1-13A0A075B5I0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ighv1-13A0A075B5I0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ighv1-13A0A075B5I0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv1-13A0A075B5I0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ighv1-13A0A075B5I0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ighv1-13A0A075B5I0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ighv1-13A0A075B5I0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Ighv1-13A0A075B5I0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ighv1-13A0A075B5I0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ighv1-13A0A075B5I0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
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