Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI70

Lrrc20, Leucine-rich repeat-containing protein 20, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc20Q8CI70 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Lrrc20Q8CI70 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Lrrc20Q8CI70 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Lrrc20Q8CI70 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Lrrc20Q8CI70 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Lrrc20Q8CI70 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Lrrc20Q8CI70 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lrrc20Q8CI70 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Lrrc20Q8CI70 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Lrrc20Q8CI70 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Lrrc20Q8CI70 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Lrrc20Q8CI70 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lrrc20Q8CI70 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Lrrc20Q8CI70 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Lrrc20Q8CI70 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Lrrc20Q8CI70 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Lrrc20Q8CI70 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Lrrc20Q8CI70 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Lrrc20Q8CI70 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Lrrc20Q8CI70 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Lrrc20Q8CI70 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Lrrc20Q8CI70 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Lrrc20Q8CI70 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Lrrc20Q8CI70 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Lrrc20Q8CI70 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Lrrc20Q8CI70 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Lrrc20Q8CI70 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Lrrc20Q8CI70 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Lrrc20Q8CI70 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Lrrc20Q8CI70 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
Lrrc20Q8CI70 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Lrrc20Q8CI70 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Lrrc20Q8CI70 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Lrrc20Q8CI70 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Lrrc20Q8CI70 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Lrrc20Q8CI70 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Lrrc20Q8CI70 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Lrrc20Q8CI70 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Lrrc20Q8CI70 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Lrrc20Q8CI70 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Lrrc20Q8CI70 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Lrrc20Q8CI70 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Lrrc20Q8CI70 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Lrrc20Q8CI70 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Lrrc20Q8CI70 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Lrrc20Q8CI70 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Lrrc20Q8CI70 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Lrrc20Q8CI70 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Lrrc20Q8CI70 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Lrrc20Q8CI70 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Lrrc20Q8CI70 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Lrrc20Q8CI70 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Lrrc20Q8CI70 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Lrrc20Q8CI70 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Lrrc20Q8CI70 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Lrrc20Q8CI70 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Lrrc20Q8CI70 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Lrrc20Q8CI70 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Lrrc20Q8CI70 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Lrrc20Q8CI70 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Lrrc20Q8CI70 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Lrrc20Q8CI70 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Lrrc20Q8CI70 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Lrrc20Q8CI70 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Lrrc20Q8CI70 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrrc20Q8CI70 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Lrrc20Q8CI70 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Lrrc20Q8CI70 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Lrrc20Q8CI70 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Lrrc20Q8CI70 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Lrrc20Q8CI70 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Lrrc20Q8CI70 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Lrrc20Q8CI70 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Lrrc20Q8CI70 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Lrrc20Q8CI70 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Lrrc20Q8CI70 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Lrrc20Q8CI70 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Lrrc20Q8CI70 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Lrrc20Q8CI70 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Lrrc20Q8CI70 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Lrrc20Q8CI70 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Lrrc20Q8CI70 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Lrrc20Q8CI70 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Lrrc20Q8CI70 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Lrrc20Q8CI70 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Lrrc20Q8CI70 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Lrrc20Q8CI70 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Lrrc20Q8CI70 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Lrrc20Q8CI70 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Lrrc20Q8CI70 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Lrrc20Q8CI70 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
Lrrc20Q8CI70 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Lrrc20Q8CI70 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Lrrc20Q8CI70 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Lrrc20Q8CI70 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Lrrc20Q8CI70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Lrrc20Q8CI70 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Lrrc20Q8CI70 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Lrrc20Q8CI70 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Lrrc20Q8CI70 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,4■■□□□ 1,18
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