Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1I0

Lyg2, Lysozyme g-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyg2Q3V1I0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Lyg2Q3V1I0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lyg2Q3V1I0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lyg2Q3V1I0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lyg2Q3V1I0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lyg2Q3V1I0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lyg2Q3V1I0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lyg2Q3V1I0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lyg2Q3V1I0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lyg2Q3V1I0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lyg2Q3V1I0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lyg2Q3V1I0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lyg2Q3V1I0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lyg2Q3V1I0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lyg2Q3V1I0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lyg2Q3V1I0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lyg2Q3V1I0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lyg2Q3V1I0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lyg2Q3V1I0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lyg2Q3V1I0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lyg2Q3V1I0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lyg2Q3V1I0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lyg2Q3V1I0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lyg2Q3V1I0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lyg2Q3V1I0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lyg2Q3V1I0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lyg2Q3V1I0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lyg2Q3V1I0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lyg2Q3V1I0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lyg2Q3V1I0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lyg2Q3V1I0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lyg2Q3V1I0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lyg2Q3V1I0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lyg2Q3V1I0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lyg2Q3V1I0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lyg2Q3V1I0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lyg2Q3V1I0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lyg2Q3V1I0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lyg2Q3V1I0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lyg2Q3V1I0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lyg2Q3V1I0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lyg2Q3V1I0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lyg2Q3V1I0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lyg2Q3V1I0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lyg2Q3V1I0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lyg2Q3V1I0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lyg2Q3V1I0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lyg2Q3V1I0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lyg2Q3V1I0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lyg2Q3V1I0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lyg2Q3V1I0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lyg2Q3V1I0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lyg2Q3V1I0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lyg2Q3V1I0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lyg2Q3V1I0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lyg2Q3V1I0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lyg2Q3V1I0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lyg2Q3V1I0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lyg2Q3V1I0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lyg2Q3V1I0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lyg2Q3V1I0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lyg2Q3V1I0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lyg2Q3V1I0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lyg2Q3V1I0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lyg2Q3V1I0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lyg2Q3V1I0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lyg2Q3V1I0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lyg2Q3V1I0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lyg2Q3V1I0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lyg2Q3V1I0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lyg2Q3V1I0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lyg2Q3V1I0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lyg2Q3V1I0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lyg2Q3V1I0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lyg2Q3V1I0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lyg2Q3V1I0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lyg2Q3V1I0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lyg2Q3V1I0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lyg2Q3V1I0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lyg2Q3V1I0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lyg2Q3V1I0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lyg2Q3V1I0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lyg2Q3V1I0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lyg2Q3V1I0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lyg2Q3V1I0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lyg2Q3V1I0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lyg2Q3V1I0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lyg2Q3V1I0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lyg2Q3V1I0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lyg2Q3V1I0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lyg2Q3V1I0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lyg2Q3V1I0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lyg2Q3V1I0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lyg2Q3V1I0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lyg2Q3V1I0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lyg2Q3V1I0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lyg2Q3V1I0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lyg2Q3V1I0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lyg2Q3V1I0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lyg2Q3V1I0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms