Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHE1

Gemin8, Gem-associated protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gemin8Q8BHE1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Gemin8Q8BHE1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gemin8Q8BHE1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gemin8Q8BHE1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Gemin8Q8BHE1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gemin8Q8BHE1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gemin8Q8BHE1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Gemin8Q8BHE1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Gemin8Q8BHE1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gemin8Q8BHE1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Gemin8Q8BHE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Gemin8Q8BHE1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Gemin8Q8BHE1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Gemin8Q8BHE1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gemin8Q8BHE1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Gemin8Q8BHE1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gemin8Q8BHE1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gemin8Q8BHE1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gemin8Q8BHE1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gemin8Q8BHE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gemin8Q8BHE1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gemin8Q8BHE1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gemin8Q8BHE1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Gemin8Q8BHE1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gemin8Q8BHE1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Gemin8Q8BHE1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gemin8Q8BHE1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gemin8Q8BHE1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Gemin8Q8BHE1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Gemin8Q8BHE1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gemin8Q8BHE1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
Gemin8Q8BHE1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gemin8Q8BHE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gemin8Q8BHE1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Gemin8Q8BHE1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Gemin8Q8BHE1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Gemin8Q8BHE1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Gemin8Q8BHE1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gemin8Q8BHE1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gemin8Q8BHE1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Gemin8Q8BHE1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Gemin8Q8BHE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Gemin8Q8BHE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Gemin8Q8BHE1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Gemin8Q8BHE1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Gemin8Q8BHE1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Gemin8Q8BHE1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Gemin8Q8BHE1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Gemin8Q8BHE1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Gemin8Q8BHE1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Gemin8Q8BHE1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gemin8Q8BHE1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gemin8Q8BHE1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gemin8Q8BHE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Gemin8Q8BHE1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Gemin8Q8BHE1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Gemin8Q8BHE1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Gemin8Q8BHE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Gemin8Q8BHE1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Gemin8Q8BHE1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gemin8Q8BHE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1,43
Gemin8Q8BHE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gemin8Q8BHE1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gemin8Q8BHE1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Gemin8Q8BHE1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,43
Gemin8Q8BHE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Gemin8Q8BHE1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Gemin8Q8BHE1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Gemin8Q8BHE1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Gemin8Q8BHE1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Gemin8Q8BHE1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Gemin8Q8BHE1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Gemin8Q8BHE1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Gemin8Q8BHE1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Gemin8Q8BHE1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Gemin8Q8BHE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Gemin8Q8BHE1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Gemin8Q8BHE1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Gemin8Q8BHE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Gemin8Q8BHE1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Gemin8Q8BHE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Gemin8Q8BHE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Gemin8Q8BHE1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Gemin8Q8BHE1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Gemin8Q8BHE1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Gemin8Q8BHE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Gemin8Q8BHE1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Gemin8Q8BHE1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gemin8Q8BHE1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gemin8Q8BHE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Gemin8Q8BHE1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Gemin8Q8BHE1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gemin8Q8BHE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gemin8Q8BHE1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gemin8Q8BHE1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Gemin8Q8BHE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Gemin8Q8BHE1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Gemin8Q8BHE1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Gemin8Q8BHE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Gemin8Q8BHE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,2 ms