Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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