Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxa1P09022 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxa1P09022 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa1P09022 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa1P09022 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa1P09022 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa1P09022 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa1P09022 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa1P09022 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa1P09022 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa1P09022 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa1P09022 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa1P09022 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa1P09022 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa1P09022 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa1P09022 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa1P09022 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa1P09022 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa1P09022 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa1P09022 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa1P09022 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa1P09022 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa1P09022 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa1P09022 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa1P09022 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa1P09022 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa1P09022 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa1P09022 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa1P09022 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa1P09022 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa1P09022 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa1P09022 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa1P09022 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa1P09022 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa1P09022 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa1P09022 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa1P09022 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa1P09022 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa1P09022 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa1P09022 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa1P09022 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa1P09022 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa1P09022 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa1P09022 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa1P09022 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa1P09022 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa1P09022 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa1P09022 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa1P09022 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa1P09022 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa1P09022 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa1P09022 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa1P09022 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa1P09022 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa1P09022 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa1P09022 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa1P09022 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa1P09022 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa1P09022 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa1P09022 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa1P09022 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa1P09022 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa1P09022 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa1P09022 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa1P09022 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa1P09022 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa1P09022 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa1P09022 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa1P09022 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa1P09022 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa1P09022 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa1P09022 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa1P09022 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa1P09022 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa1P09022 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa1P09022 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa1P09022 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa1P09022 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa1P09022 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa1P09022 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa1P09022 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa1P09022 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa1P09022 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa1P09022 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa1P09022 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa1P09022 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa1P09022 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa1P09022 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa1P09022 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa1P09022 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa1P09022 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa1P09022 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa1P09022 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa1P09022 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa1P09022 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa1P09022 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa1P09022 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa1P09022 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa1P09022 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa1P09022 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms