Protein–RNA interactions for Protein: Q60870

Reep5, Receptor expression-enhancing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep5Q60870 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Reep5Q60870 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Reep5Q60870 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Reep5Q60870 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Reep5Q60870 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Reep5Q60870 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Reep5Q60870 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Reep5Q60870 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Reep5Q60870 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Reep5Q60870 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Reep5Q60870 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Reep5Q60870 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Reep5Q60870 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Reep5Q60870 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Reep5Q60870 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Reep5Q60870 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Reep5Q60870 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Reep5Q60870 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Reep5Q60870 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Reep5Q60870 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Reep5Q60870 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Reep5Q60870 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Reep5Q60870 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Reep5Q60870 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Reep5Q60870 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Reep5Q60870 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Reep5Q60870 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Reep5Q60870 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Reep5Q60870 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Reep5Q60870 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Reep5Q60870 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Reep5Q60870 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Reep5Q60870 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Reep5Q60870 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Reep5Q60870 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Reep5Q60870 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Reep5Q60870 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Reep5Q60870 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Reep5Q60870 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Reep5Q60870 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Reep5Q60870 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Reep5Q60870 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Reep5Q60870 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Reep5Q60870 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Reep5Q60870 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Reep5Q60870 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Reep5Q60870 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Reep5Q60870 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Reep5Q60870 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Reep5Q60870 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Reep5Q60870 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Reep5Q60870 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Reep5Q60870 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Reep5Q60870 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Reep5Q60870 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Reep5Q60870 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Reep5Q60870 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Reep5Q60870 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Reep5Q60870 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Reep5Q60870 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Reep5Q60870 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Reep5Q60870 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Reep5Q60870 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Reep5Q60870 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Reep5Q60870 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Reep5Q60870 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Reep5Q60870 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Reep5Q60870 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Reep5Q60870 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Reep5Q60870 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Reep5Q60870 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Reep5Q60870 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Reep5Q60870 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Reep5Q60870 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep5Q60870 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Reep5Q60870 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Reep5Q60870 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reep5Q60870 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reep5Q60870 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Reep5Q60870 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Reep5Q60870 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Reep5Q60870 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Reep5Q60870 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Reep5Q60870 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Reep5Q60870 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Reep5Q60870 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Reep5Q60870 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Reep5Q60870 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Reep5Q60870 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Reep5Q60870 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Reep5Q60870 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Reep5Q60870 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep5Q60870 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep5Q60870 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep5Q60870 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Reep5Q60870 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reep5Q60870 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reep5Q60870 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Reep5Q60870 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Reep5Q60870 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms