Protein–RNA interactions for Protein: Q60870

Reep5, Receptor expression-enhancing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep5Q60870 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Reep5Q60870 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Reep5Q60870 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Reep5Q60870 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Reep5Q60870 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Reep5Q60870 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Reep5Q60870 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Reep5Q60870 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Reep5Q60870 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Reep5Q60870 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Reep5Q60870 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Reep5Q60870 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Reep5Q60870 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Reep5Q60870 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Reep5Q60870 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Reep5Q60870 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Reep5Q60870 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Reep5Q60870 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Reep5Q60870 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Reep5Q60870 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Reep5Q60870 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Reep5Q60870 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Reep5Q60870 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Reep5Q60870 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Reep5Q60870 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Reep5Q60870 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Reep5Q60870 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
Reep5Q60870 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Reep5Q60870 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Reep5Q60870 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Reep5Q60870 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Reep5Q60870 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Reep5Q60870 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Reep5Q60870 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Reep5Q60870 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Reep5Q60870 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Reep5Q60870 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Reep5Q60870 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Reep5Q60870 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Reep5Q60870 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Reep5Q60870 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Reep5Q60870 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Reep5Q60870 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Reep5Q60870 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Reep5Q60870 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Reep5Q60870 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Reep5Q60870 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Reep5Q60870 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Reep5Q60870 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Reep5Q60870 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Reep5Q60870 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Reep5Q60870 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Reep5Q60870 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Reep5Q60870 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Reep5Q60870 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Reep5Q60870 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Reep5Q60870 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Reep5Q60870 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Reep5Q60870 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Reep5Q60870 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Reep5Q60870 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Reep5Q60870 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Reep5Q60870 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Reep5Q60870 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
Reep5Q60870 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Reep5Q60870 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Reep5Q60870 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Reep5Q60870 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Reep5Q60870 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Reep5Q60870 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Reep5Q60870 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Reep5Q60870 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Reep5Q60870 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Reep5Q60870 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Reep5Q60870 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Reep5Q60870 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Reep5Q60870 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Reep5Q60870 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Reep5Q60870 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Reep5Q60870 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Reep5Q60870 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Reep5Q60870 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Reep5Q60870 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Reep5Q60870 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Reep5Q60870 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Reep5Q60870 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Reep5Q60870 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Reep5Q60870 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Reep5Q60870 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Reep5Q60870 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Reep5Q60870 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,21
Reep5Q60870 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Reep5Q60870 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Reep5Q60870 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Reep5Q60870 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Reep5Q60870 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Reep5Q60870 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Reep5Q60870 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
Reep5Q60870 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Reep5Q60870 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms