Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Ercc8Q8CFD5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ercc8Q8CFD5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ercc8Q8CFD5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ercc8Q8CFD5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Ercc8Q8CFD5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ercc8Q8CFD5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Ercc8Q8CFD5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ercc8Q8CFD5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Ercc8Q8CFD5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ercc8Q8CFD5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ercc8Q8CFD5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Ercc8Q8CFD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ercc8Q8CFD5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ercc8Q8CFD5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Ercc8Q8CFD5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ercc8Q8CFD5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Ercc8Q8CFD5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ercc8Q8CFD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Ercc8Q8CFD5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Ercc8Q8CFD5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Ercc8Q8CFD5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ercc8Q8CFD5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ercc8Q8CFD5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ercc8Q8CFD5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ercc8Q8CFD5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Ercc8Q8CFD5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
Ercc8Q8CFD5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ercc8Q8CFD5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ercc8Q8CFD5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ercc8Q8CFD5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ercc8Q8CFD5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ercc8Q8CFD5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ercc8Q8CFD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ercc8Q8CFD5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ercc8Q8CFD5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ercc8Q8CFD5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ercc8Q8CFD5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ercc8Q8CFD5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
Ercc8Q8CFD5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ercc8Q8CFD5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ercc8Q8CFD5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ercc8Q8CFD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
Ercc8Q8CFD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ercc8Q8CFD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ercc8Q8CFD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ercc8Q8CFD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ercc8Q8CFD5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ercc8Q8CFD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ercc8Q8CFD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ercc8Q8CFD5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ercc8Q8CFD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ercc8Q8CFD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
Ercc8Q8CFD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ercc8Q8CFD5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ercc8Q8CFD5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ercc8Q8CFD5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ercc8Q8CFD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ercc8Q8CFD5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ercc8Q8CFD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ercc8Q8CFD5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ercc8Q8CFD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Ercc8Q8CFD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ercc8Q8CFD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ercc8Q8CFD5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ercc8Q8CFD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,64■■□□□ 1,21
Ercc8Q8CFD5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ercc8Q8CFD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ercc8Q8CFD5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ercc8Q8CFD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ercc8Q8CFD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
Ercc8Q8CFD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ercc8Q8CFD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ercc8Q8CFD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ercc8Q8CFD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Ercc8Q8CFD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Ercc8Q8CFD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ercc8Q8CFD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ercc8Q8CFD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ercc8Q8CFD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ercc8Q8CFD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ercc8Q8CFD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ercc8Q8CFD5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ercc8Q8CFD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Ercc8Q8CFD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ercc8Q8CFD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Ercc8Q8CFD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ercc8Q8CFD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ercc8Q8CFD5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ercc8Q8CFD5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Ercc8Q8CFD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
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