Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
BC117090L7N257 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
BC117090L7N257 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
BC117090L7N257 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
BC117090L7N257 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
BC117090L7N257 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
BC117090L7N257 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
BC117090L7N257 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
BC117090L7N257 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
BC117090L7N257 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
BC117090L7N257 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
BC117090L7N257 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
BC117090L7N257 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
BC117090L7N257 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
BC117090L7N257 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
BC117090L7N257 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
BC117090L7N257 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
BC117090L7N257 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
BC117090L7N257 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
BC117090L7N257 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
BC117090L7N257 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
BC117090L7N257 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
BC117090L7N257 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
BC117090L7N257 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
BC117090L7N257 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
BC117090L7N257 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
BC117090L7N257 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
BC117090L7N257 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
BC117090L7N257 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
BC117090L7N257 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
BC117090L7N257 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
BC117090L7N257 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
BC117090L7N257 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
BC117090L7N257 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
BC117090L7N257 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
BC117090L7N257 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
BC117090L7N257 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
BC117090L7N257 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
BC117090L7N257 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
BC117090L7N257 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
BC117090L7N257 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
BC117090L7N257 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
BC117090L7N257 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
BC117090L7N257 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
BC117090L7N257 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
BC117090L7N257 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
BC117090L7N257 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
BC117090L7N257 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
BC117090L7N257 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
BC117090L7N257 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
BC117090L7N257 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,3■■□□□ 1,48
BC117090L7N257 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,21■■□□□ 1,47
BC117090L7N257 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,47
BC117090L7N257 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
BC117090L7N257 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
BC117090L7N257 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
BC117090L7N257 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
BC117090L7N257 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
BC117090L7N257 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
BC117090L7N257 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
BC117090L7N257 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
BC117090L7N257 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
BC117090L7N257 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
BC117090L7N257 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
BC117090L7N257 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
BC117090L7N257 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
BC117090L7N257 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
BC117090L7N257 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,75■■□□□ 1,39
BC117090L7N257 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
BC117090L7N257 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
BC117090L7N257 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
BC117090L7N257 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
BC117090L7N257 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
BC117090L7N257 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
BC117090L7N257 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
BC117090L7N257 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,56■■□□□ 1,36
BC117090L7N257 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
BC117090L7N257 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
BC117090L7N257 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
BC117090L7N257 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
BC117090L7N257 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
BC117090L7N257 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
BC117090L7N257 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
BC117090L7N257 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
BC117090L7N257 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
BC117090L7N257 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,39■■□□□ 1,34
BC117090L7N257 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
BC117090L7N257 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
BC117090L7N257 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
BC117090L7N257 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
BC117090L7N257 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
BC117090L7N257 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
BC117090L7N257 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
BC117090L7N257 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
BC117090L7N257 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
BC117090L7N257 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
BC117090L7N257 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,17■■□□□ 1,3
BC117090L7N257 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
BC117090L7N257 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
BC117090L7N257 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
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