Protein–RNA interactions for Protein: Q61041

Npy4r, Neuropeptide Y receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npy4rQ61041 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Npy4rQ61041 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npy4rQ61041 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npy4rQ61041 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npy4rQ61041 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Npy4rQ61041 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Npy4rQ61041 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Npy4rQ61041 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Npy4rQ61041 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npy4rQ61041 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npy4rQ61041 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npy4rQ61041 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Npy4rQ61041 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npy4rQ61041 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npy4rQ61041 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npy4rQ61041 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npy4rQ61041 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Npy4rQ61041 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Npy4rQ61041 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Npy4rQ61041 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npy4rQ61041 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npy4rQ61041 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Npy4rQ61041 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npy4rQ61041 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npy4rQ61041 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npy4rQ61041 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npy4rQ61041 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npy4rQ61041 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Npy4rQ61041 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npy4rQ61041 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npy4rQ61041 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npy4rQ61041 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npy4rQ61041 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npy4rQ61041 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npy4rQ61041 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npy4rQ61041 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npy4rQ61041 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npy4rQ61041 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Npy4rQ61041 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npy4rQ61041 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npy4rQ61041 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Npy4rQ61041 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npy4rQ61041 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Npy4rQ61041 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npy4rQ61041 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npy4rQ61041 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npy4rQ61041 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npy4rQ61041 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npy4rQ61041 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Npy4rQ61041 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npy4rQ61041 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Npy4rQ61041 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Npy4rQ61041 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npy4rQ61041 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npy4rQ61041 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npy4rQ61041 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npy4rQ61041 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npy4rQ61041 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npy4rQ61041 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npy4rQ61041 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Npy4rQ61041 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npy4rQ61041 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npy4rQ61041 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npy4rQ61041 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Npy4rQ61041 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npy4rQ61041 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npy4rQ61041 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npy4rQ61041 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npy4rQ61041 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npy4rQ61041 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npy4rQ61041 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npy4rQ61041 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npy4rQ61041 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npy4rQ61041 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npy4rQ61041 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Npy4rQ61041 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Npy4rQ61041 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Npy4rQ61041 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npy4rQ61041 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npy4rQ61041 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npy4rQ61041 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npy4rQ61041 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npy4rQ61041 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npy4rQ61041 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npy4rQ61041 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npy4rQ61041 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npy4rQ61041 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npy4rQ61041 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npy4rQ61041 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npy4rQ61041 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npy4rQ61041 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npy4rQ61041 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npy4rQ61041 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npy4rQ61041 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npy4rQ61041 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npy4rQ61041 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Npy4rQ61041 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npy4rQ61041 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npy4rQ61041 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Npy4rQ61041 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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