Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5R1

Ighv5-17, Immunoglobulin heavy variable 5-17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Ighv5-17A0A075B5R1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ighv5-17A0A075B5R1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ighv5-17A0A075B5R1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ighv5-17A0A075B5R1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ighv5-17A0A075B5R1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ighv5-17A0A075B5R1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Ighv5-17A0A075B5R1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ighv5-17A0A075B5R1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Ighv5-17A0A075B5R1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ighv5-17A0A075B5R1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ighv5-17A0A075B5R1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Ighv5-17A0A075B5R1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ighv5-17A0A075B5R1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ighv5-17A0A075B5R1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Ighv5-17A0A075B5R1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ighv5-17A0A075B5R1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Ighv5-17A0A075B5R1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ighv5-17A0A075B5R1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ighv5-17A0A075B5R1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ighv5-17A0A075B5R1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ighv5-17A0A075B5R1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ighv5-17A0A075B5R1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ighv5-17A0A075B5R1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
Ighv5-17A0A075B5R1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ighv5-17A0A075B5R1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Ighv5-17A0A075B5R1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Ighv5-17A0A075B5R1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ighv5-17A0A075B5R1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ighv5-17A0A075B5R1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ighv5-17A0A075B5R1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Ighv5-17A0A075B5R1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ighv5-17A0A075B5R1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ighv5-17A0A075B5R1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ighv5-17A0A075B5R1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Ighv5-17A0A075B5R1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ighv5-17A0A075B5R1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ighv5-17A0A075B5R1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ighv5-17A0A075B5R1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,64■■□□□ 1,37
Ighv5-17A0A075B5R1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ighv5-17A0A075B5R1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Ighv5-17A0A075B5R1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ighv5-17A0A075B5R1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ighv5-17A0A075B5R1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ighv5-17A0A075B5R1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ighv5-17A0A075B5R1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ighv5-17A0A075B5R1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv5-17A0A075B5R1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ighv5-17A0A075B5R1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv5-17A0A075B5R1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ighv5-17A0A075B5R1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv5-17A0A075B5R1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv5-17A0A075B5R1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ighv5-17A0A075B5R1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
Ighv5-17A0A075B5R1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ighv5-17A0A075B5R1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ighv5-17A0A075B5R1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ighv5-17A0A075B5R1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ighv5-17A0A075B5R1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ighv5-17A0A075B5R1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ighv5-17A0A075B5R1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv5-17A0A075B5R1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv5-17A0A075B5R1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ighv5-17A0A075B5R1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ighv5-17A0A075B5R1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Ighv5-17A0A075B5R1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ighv5-17A0A075B5R1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ighv5-17A0A075B5R1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ighv5-17A0A075B5R1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ighv5-17A0A075B5R1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Ighv5-17A0A075B5R1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ighv5-17A0A075B5R1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ighv5-17A0A075B5R1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ighv5-17A0A075B5R1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ighv5-17A0A075B5R1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv5-17A0A075B5R1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ighv5-17A0A075B5R1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ighv5-17A0A075B5R1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Ighv5-17A0A075B5R1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ighv5-17A0A075B5R1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ighv5-17A0A075B5R1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Ighv5-17A0A075B5R1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Ighv5-17A0A075B5R1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ighv5-17A0A075B5R1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ighv5-17A0A075B5R1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ighv5-17A0A075B5R1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ighv5-17A0A075B5R1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ighv5-17A0A075B5R1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ighv5-17A0A075B5R1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,8 ms