Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxb5P09079 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxb5P09079 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxb5P09079 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxb5P09079 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxb5P09079 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxb5P09079 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxb5P09079 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb5P09079 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxb5P09079 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb5P09079 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxb5P09079 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxb5P09079 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxb5P09079 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxb5P09079 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb5P09079 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb5P09079 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb5P09079 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb5P09079 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb5P09079 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb5P09079 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb5P09079 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb5P09079 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb5P09079 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxb5P09079 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb5P09079 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxb5P09079 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb5P09079 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb5P09079 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb5P09079 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb5P09079 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb5P09079 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb5P09079 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb5P09079 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb5P09079 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb5P09079 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb5P09079 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb5P09079 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb5P09079 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb5P09079 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb5P09079 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb5P09079 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxb5P09079 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb5P09079 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb5P09079 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb5P09079 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxb5P09079 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb5P09079 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb5P09079 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb5P09079 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb5P09079 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb5P09079 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb5P09079 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb5P09079 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxb5P09079 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb5P09079 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxb5P09079 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxb5P09079 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxb5P09079 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb5P09079 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxb5P09079 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb5P09079 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb5P09079 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb5P09079 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb5P09079 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb5P09079 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb5P09079 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb5P09079 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb5P09079 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb5P09079 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb5P09079 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb5P09079 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb5P09079 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxb5P09079 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb5P09079 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxb5P09079 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxb5P09079 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxb5P09079 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb5P09079 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxb5P09079 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb5P09079 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb5P09079 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb5P09079 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb5P09079 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb5P09079 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb5P09079 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb5P09079 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb5P09079 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb5P09079 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb5P09079 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb5P09079 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb5P09079 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb5P09079 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb5P09079 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb5P09079 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb5P09079 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb5P09079 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb5P09079 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb5P09079 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb5P09079 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms