RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RKM2	Q03942	479 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	IZH4	Q99393	312 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	CCP1	P00431	361 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YML002W	P0CF17	737 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.93	□□□□□ -1.46	not detected
AMD1	YML035C	MEI4	P29467	408 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SYN8	P31377	255 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PEX2	P32800	271 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YIR016W	P40572	265 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YNL034W	P53963	612 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YNL018C	P53976	612 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PNP1	Q05788	311 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	ACM1	Q08981	209 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YOL087C	Q99247	1116 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SLY1	P22213	666 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SAW1	P39735	261 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	AAD4	Q07747	329 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PEP5	P12868	1029 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PLC1	P32383	869 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	HSP78	P33416	811 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YBR056W	P38081	501 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YBR225W	P38321	900 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	VHC1	P38329	1120 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PRM9	P39551	298 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	FLC2	P39719	783 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	TRS85	P46944	698 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	VTC4	P47075	721 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	HER2	Q03557	464 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	LCB4	Q12246	624 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YCR015C	P25616	317 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	OXP1	P28273	1286 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	ECM13	P38195	257 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	POP4	P38336	279 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MND2	P40577	368 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MRX6	P48564	524 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	HOT1	Q03213	719 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	GRX8	Q05926	109 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	STE23	Q06010	1027 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	TPO1	Q07824	586 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SPO16	P17122	198 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RAD16	P31244	790 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YBP1	P38315	674 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	AIM18	P38884	321 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MAF1	P41910	395 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RGD2	P43556	714 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YJR039W	P47107	1121 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RFX1	P48743	811 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	KTR6	P54070	446 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PMT7	Q06644	662 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	GPM3	Q12326	303 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	ARP7	Q12406	477 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	GCR1	P07261	785 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RIM4	P38741	713 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SFB3	P38810	929 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	LAM1	P38851	1228 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	RRT5	P43607	289 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	YLL056C	Q12177	298 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	SVS1	Q12254	260 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	AVL9	Q12500	764 aa		5.9	□□□□□ -1.46
AMD1	YML035C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.9	□□□□□ -1.47	not detected
AMD1	YML035C	SPE1	P08432	466 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	HMG2	P12684	1045 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YIH1	P25637	258 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ISF1	P32488	338 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RIM101	P33400	625 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	INA22	P40576	216 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RTT101	P47050	842 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	VPS9	P54787	451 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	GCN5	Q03330	439 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	USA1	Q03714	838 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PIG1	Q06216	648 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	NDJ1	Q12366	352 aa		5.9	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ADH4	P10127	382 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PDE1	P22434	369 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	DAL1	P32375	460 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RPC37	P36121	282 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	FUI1	P38196	639 aa		5.89	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47

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