RNA–Protein interactions for RNA: YJR143C

PMT4, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT4, Length 2,289 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT4	YJR143C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MIC60	P36112	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SRO77	P38163	1010 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GIC1	P38785	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GPB2	P39717	880 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PRM2	P40534	656 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	STU2	P46675	888 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SFB2	P53953	876 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ACM1	Q08981	209 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	NMD4	Q12129	218 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	DIF1	O13577	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PRP28	P23394	588 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RIT1	P23796	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	NFS1	P25374	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MRX1	P40050	688 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ZIM17	P42844	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	LAM5	P43560	674 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GCR2	Q01722	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MMR1	Q06324	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YPS7	Q06325	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ENT4	Q07872	247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SKM1	Q12469	655 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YCK1	P23291	538 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	DGR2	P32330	852 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MRP20	P32387	263 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SUR1	P33300	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ATG19	P35193	415 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YER158C	P40095	573 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RPN14	P53196	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	GPM3	Q12326	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	KAR3	P17119	729 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	VPS17	P32913	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	HEL1	P36113	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	UGA2	P38067	497 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	CTM1	P38818	585 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YAR028W	P39548	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	TCB2	P48231	1178 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	HFM1	P51979	1187 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	EOS1	P53938	366 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ACS1	Q01574	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MEC3	Q02574	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YAP6	Q03935	383 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SMF1	P38925	575 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
PMT4	YJR143C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SHE4	P51534	789 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	IMA1	P53051	589 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YGR266W	P53326	701 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ADA2	Q02336	434 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RBA50	Q04418	439 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	DON1	Q05610	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	FMP45	Q07651	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
PMT4	YJR143C	HUA2	Q12134	243 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	MDY2	Q12285	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	COX17	Q12287	69 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	LDB19	Q12502	818 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	FLR1	P38124	548 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	UBP13	P38187	747 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	KEL2	P50090	882 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	JJJ1	P53863	590 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	HDA1	P53973	706 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	TOF2	Q02208	771 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RRN5	Q02983	363 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	SRT1	Q03175	343 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	THI21	Q08975	551 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMT4	YJR143C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	STE12	P13574	688 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	MRPL25	P23369	157 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	OCA4	P25366	362 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	RSC6	P25632	483 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	TRK2	P28584	889 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	LOT5	P34234	306 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PMT4	YJR143C	ATG14	P38270	344 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 82.4 ms