RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A IRC7P43623 340 aa3.49□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A BI2P03873 423 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A PEX6P33760 1030 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A FTR1P40088 404 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A TDA10P42938 290 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A SAE2P46946 345 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A NNF1P47149 201 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A SAP4P53036 818 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YOL098CQ12496 1037 aa3.48□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A PRE4P30657 266 aa3.47□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YEL025CP39991 1188 aa3.47□□□□□ -1.85
YHL009W-AYHL009W-A YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A CAP1P28495 268 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
YHL009W-AYHL009W-A BUD6P41697 788 aa3.46□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A UGO1Q03327 502 aa3.46□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
YHL009W-AYHL009W-A YEL076C-AP0CX16 216 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YLR464WP0CX17 216 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A HOP1P20050 605 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YPT10P38146 199 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A OCA5P38738 679 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A MTG2P38860 518 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A DUN1P39009 513 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YEL076CP39971 216 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YIR016WP40572 265 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A MDV1P47025 714 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A HLR1Q04429 423 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A STP4Q07351 490 aa3.45□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A PHO2P07269 559 aa3.44□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A MSH2P25847 964 aa3.44□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A CCL1P37366 393 aa3.44□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A CDS1P38221 457 aa3.44□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YGL260WP53056 76 aa3.44□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A BOP3P53958 396 aa3.44□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A HRD3Q05787 833 aa3.44□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YKL091CP33324 310 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A DED81P38707 554 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A TAF4P50105 388 aa3.43□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A AAT1Q01802 451 aa3.43□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A RPN4Q03465 531 aa3.43□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A PCL8Q08966 492 aa3.43□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YPT1P01123 206 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A COQ3P27680 312 aa3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A NUP82P40368 713 aa3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A GRS2Q06817 618 aa3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A GUD1Q07729 489 aa3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A NRT1Q08485 598 aa3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A YLR125WQ12138 136 aa3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A MET13P53128 600 aa3.41□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A USA1Q03714 838 aa3.41□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A AIM41Q12032 185 aa3.41□□□□□ -1.86
YHL009W-AYHL009W-A SWI6P09959 803 aa3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A PHO8P11491 566 aa3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A THI4P32318 326 aa3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A EHT1P38295 451 aa3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A GND1P38720 489 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A PRM2P40534 656 aa3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A NOP15P53927 220 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A ARR3Q06598 404 aa3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A UBX3Q12229 455 aa3.4□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YCR043CP25361 127 aa3.39□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A NSE5Q03718 556 aa3.39□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.39□□□□□ -1.87not detected
YHL009W-AYHL009W-A ATX2Q12067 313 aa3.39□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A AAC1P04710 309 aa3.38□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YPK1P12688 680 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
YHL009W-AYHL009W-A LRO1P40345 661 aa3.38□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A CYK3Q07533 885 aa3.38□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A TDA3P38758 523 aa3.37□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A RTT107P38850 1070 aa3.37□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A SNU56Q03782 492 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YCG1Q06680 1035 aa3.37□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A SCO2P38072 301 aa3.36□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A SDS24P38314 527 aa3.36□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A TES1P41903 349 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YNL058CP53947 316 aa3.36□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A DSE3Q08729 430 aa3.36□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YHR033WP38690 423 aa3.35□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A IMD2P38697 523 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YIL152WP40455 235 aa3.35□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A MNN1P39106 762 aa3.34□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A YJL193WP39542 402 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 302.9 ms