RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 TGS1Q12052 315 aa1.27□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 CBS2P14905 389 aa1.26□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data1.26□□□□□ -2.21not detected
Q0143Q0143 BRN1P38170 754 aa1.26□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 YPT11P48559 417 aa1.26□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 EFR3Q03653 782 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 CET1O13297 549 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 YML002WP0CF17 737 aa1.25□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 YJU2P28320 278 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 TMN3P40071 706 aa1.25□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 BIT61P47041 543 aa1.25□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 TOM70P07213 617 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 CDC23P16522 626 aa1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 IMD2P38697 523 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 YHR218WP38899 603 aa1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 SPF1P39986 1215 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 IMD3P50095 523 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 SAP4P53036 818 aa1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 PCL10P53124 433 aa1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 GSH2Q08220 491 aa1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 PCL8Q08966 492 aa1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 PNO1Q99216 274 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 ILS1P09436 1072 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 YKR051WP36142 418 aa1.23□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 ERP6P53198 216 aa1.23□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 ARP4P80428 489 aa1.23□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 MAD1P40957 749 aa1.22□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 RPS15Q01855 142 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 CYK3Q07533 885 aa1.22□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 AHA1Q12449 350 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 YBR298C-AQ8TGK4 73 aa1.22□□□□□ -2.21
Q0143Q0143 ARE1P25628 610 aa1.21□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YPT7P32939 208 aa1.21□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YKR018CP36114 725 aa1.21□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 CIN1P40987 1014 aa1.21□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 TDA5Q06417 326 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 SEC18P18759 758 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 PFA4Q12006 378 aa1.2□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 TAH18Q12181 623 aa1.2□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 MAK32P23060 363 aa1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 RPL8BP29453 256 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 PRO3P32263 286 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YPT10P38146 199 aa1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 FTH1P38310 465 aa1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 SPG5P42933 373 aa1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 VBA4Q04602 768 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 PIN2Q12057 282 aa1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 GET3Q12154 354 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 SEC1P30619 724 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 GSH1P32477 678 aa1.18□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 RPN10P38886 268 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YJL070CP40361 888 aa1.18□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 CUL3P53202 744 aa1.18□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 IGO1P53897 168 aa1.18□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YNL058CP53947 316 aa1.18□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 CNA1P23287 553 aa1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 BRE5P53741 515 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YNL144CP53907 740 aa1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 SPO75Q07798 868 aa1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 VHS3Q08438 674 aa1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 RRI1Q12468 440 aa1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YOR131CQ12486 218 aa1.17□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 FRS1P15624 595 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 QRI7P43122 407 aa1.16□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 YGR054WP53235 642 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
Q0143Q0143 PMS1P14242 873 aa1.15□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 NAP1P25293 417 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 HXT1P32465 570 aa1.15□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 PET127P32606 800 aa1.14□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 CCL1P37366 393 aa1.14□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 PCL6P40038 420 aa1.14□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 HUL4P40985 892 aa1.14□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 PRP22P24384 1145 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 DHR2P36009 735 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 SRO77P38163 1010 aa1.13□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 PTH1P38876 190 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 YHR202WP38887 602 aa1.13□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 RBG2P53295 368 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data1.13□□□□□ -2.23not detected
Q0143Q0143 FAB1P34756 2278 aa1.12□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 MCD4P36051 919 aa1.12□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 RAD26P40352 1085 aa1.12□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 TIM50Q02776 476 aa1.12□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 FDC1Q03034 503 aa1.12□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 CRT10Q08226 957 aa1.12□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 HOP1P20050 605 aa1.11□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 BUD14P27637 709 aa1.11□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 CAP1P28495 268 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 ASF1P32447 279 aa1.11□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 NIC96P34077 839 aa1.11□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 YPI1P43587 155 aa1.1□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 YOR389WQ08912 624 aa1.1□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 AAC1P04710 309 aa1.09□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 SSZ1P38788 538 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 YPS7Q06325 596 aa1.09□□□□□ -2.23
Q0143Q0143 OSH2Q12451 1283 aa1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.5 ms