RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ADY4	Q05955	493 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	KCS1	Q12494	1050 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SPS1	P08458	490 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YCK1	P23291	538 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CWH43	P25618	953 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GCS1	P35197	352 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CST26	P38226	397 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	HSM3	P38348	480 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	LYS14	P40971	790 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ECM27	P47144	725 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SHE4	P51534	789 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NNF2	P53253	936 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CBK1	P53894	756 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MUB1	Q03162	620 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RBA50	Q04418	439 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YPL260W	Q08977	551 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SLP1	Q12232	587 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	VCX1	Q99385	411 aa		3.03	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MSH1	P25846	959 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RFC3	P38629	340 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NPR3	P38742	1146 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SKN7	P38889	622 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	EFM3	P47163	339 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YNR063W	P53749	607 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YHM2	Q04013	314 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GIS4	Q04233	774 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TAP42	Q04372	366 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SMC6	Q12749	1114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ADE8	P04161	214 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PRE4	P30657	266 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PRO1	P32264	428 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	LEM3	P42838	414 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ERO1	Q03103	563 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SOV1	Q04748	898 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	AAD4	Q07747	329 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RTT109	Q07794	436 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NFI1	Q12216	726 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	URA3	P03962	267 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PHO81	P17442	1178 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RAD51	P25454	400 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SMF1	P38925	575 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	FET4	P40988	552 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YJL181W	P46987	611 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	VPS9	P54787	451 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	EAR1	Q03212	550 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SPC19	Q03954	165 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TRI1	Q05024	226 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	AIM6	Q07716	390 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
AI2	Q0055	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	UAF30	Q08747	228 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SEG2	P34250	1132 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	FLR1	P38124	548 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SHU2	P38957	223 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GPB2	P39717	880 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	THI6	P41835	540 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	FMS1	P50264	508 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ALT1	P52893	592 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TAM41	P53230	385 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
AI2	Q0055	OAZ1	Q02803	292 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MSC3	Q05812	728 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CTI6	Q08923	506 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	POL3	P15436	1097 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	VPS33	P20795	691 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	STE14	P32584	239 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YKL077W	P36081	392 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	3	□□□□□ -1.93	not detected
AI2	Q0055	FLC2	P39719	783 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RGI2	P40188	164 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3	□□□□□ -1.93	not detected
AI2	Q0055	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ORC4	P54791	529 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RAD33	Q04231	177 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93

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