RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SNF5P18480 905 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YIH1P25637 258 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC65P29478 273 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P MET22P32179 357 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P RML2P32611 393 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC6P32844 805 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P HSP78P33416 811 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SAP190P36123 1033 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P PSY4P38193 441 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P NPR3P38742 1146 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P PIK1P39104 1066 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YER189WP40104 122 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YAP5P40574 245 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YPS6P40583 537 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P FIG4P42837 879 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P EMW1P42842 904 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P KRE33P53914 1056 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P AQR1P53943 586 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P KTR6P54070 446 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX13P80667 386 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SSL2Q00578 843 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P BET4Q00618 327 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P GYL1Q04322 720 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL129WQ07555 291 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TMA16Q08687 178 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P NDD1Q08887 554 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P FLC1Q08967 793 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SVS1Q12254 260 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P CCP1P00431 361 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL22AP05749 121 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P REV1P12689 985 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P ADY2P25613 283 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SRB2P34162 210 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SRX1P36077 127 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P JNM1P36224 373 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SHM1P37292 490 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YMC2P38087 329 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SAK1P38990 1142 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P DUN1P39009 513 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P RVS167P39743 482 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF34P40217 347 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P HYR1P40581 163 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P MMM1P41800 426 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO86P46956 311 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR079WP47126 109 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P MNN10P50108 393 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P EMC4P53073 190 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P HOP2P53187 214 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P REG1Q00816 1014 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL014WQ02606 381 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P RKM2Q03942 479 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P ARA2Q04212 335 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P HMI1Q12039 706 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P LCB4Q12246 624 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P BI2P03873 423 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P BI4P03879 638 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TUP1P16649 713 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P MET16P18408 261 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YJU3P28321 313 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TFB1P32776 642 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP4P32902 394 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P UTH1P36135 365 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM13P38195 257 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P EFM2P38347 419 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P RTT107P38850 1070 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P LTP1P40347 161 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR061WP40355 935 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SDS3P40505 327 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SER33P40510 469 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SNZ3P43545 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P RTT101P47050 842 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TRF5P48561 642 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P AMA1P50082 593 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TAD1P53065 400 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P TAN1P53072 289 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P FLC3P53121 802 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR063WP53749 607 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P SNZ2P53824 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL062WQ02781 134 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P UME1Q03010 460 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P ADI1Q03677 179 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR287CQ05881 355 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)PtW(CCA)P EAF1Q06337 982 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19 ms