RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SNF5P18480 905 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YIH1P25637 258 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC65P29478 273 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M MET22P32179 357 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RML2P32611 393 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC6P32844 805 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP78P33416 811 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SAP190P36123 1033 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PSY4P38193 441 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M NPR3P38742 1146 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PIK1P39104 1066 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YER189WP40104 122 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YAP5P40574 245 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YPS6P40583 537 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M FIG4P42837 879 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M EMW1P42842 904 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M KRE33P53914 1056 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AQR1P53943 586 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M KTR6P54070 446 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX13P80667 386 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SSL2Q00578 843 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M BET4Q00618 327 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M GYL1Q04322 720 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL129WQ07555 291 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TMA16Q08687 178 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M NDD1Q08887 554 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M FLC1Q08967 793 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SVS1Q12254 260 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CCP1P00431 361 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL22AP05749 121 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M REV1P12689 985 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ADY2P25613 283 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SRB2P34162 210 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SRX1P36077 127 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M JNM1P36224 373 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SHM1P37292 490 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YMC2P38087 329 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SAK1P38990 1142 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M DUN1P39009 513 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RVS167P39743 482 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TIF34P40217 347 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HYR1P40581 163 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M MMM1P41800 426 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO86P46956 311 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR079WP47126 109 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M MNN10P50108 393 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M EMC4P53073 190 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HOP2P53187 214 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M REG1Q00816 1014 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL014WQ02606 381 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RKM2Q03942 479 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ARA2Q04212 335 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HMI1Q12039 706 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M LCB4Q12246 624 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M BI2P03873 423 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M BI4P03879 638 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TUP1P16649 713 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M MET16P18408 261 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YJU3P28321 313 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TFB1P32776 642 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M MRP4P32902 394 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M UTH1P36135 365 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM13P38195 257 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M EFM2P38347 419 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RTT107P38850 1070 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M LTP1P40347 161 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR061WP40355 935 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SDS3P40505 327 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SER33P40510 469 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SNZ3P43545 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RTT101P47050 842 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TRF5P48561 642 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AMA1P50082 593 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TAD1P53065 400 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TAN1P53072 289 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M FLC3P53121 802 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR063WP53749 607 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SNZ2P53824 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL062WQ02781 134 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M UME1Q03010 460 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ADI1Q03677 179 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR287CQ05881 355 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M EAF1Q06337 982 aa2.73□□□□□ -1.97
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