RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SNF5P18480 905 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YIH1P25637 258 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC65P29478 273 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K MET22P32179 357 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RML2P32611 393 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC6P32844 805 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HSP78P33416 811 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SAP190P36123 1033 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PSY4P38193 441 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K NPR3P38742 1146 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PIK1P39104 1066 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YER189WP40104 122 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YAP5P40574 245 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YPS6P40583 537 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K FIG4P42837 879 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K EMW1P42842 904 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K KRE33P53914 1056 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K AQR1P53943 586 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K KTR6P54070 446 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX13P80667 386 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SSL2Q00578 843 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K BET4Q00618 327 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K GYL1Q04322 720 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL129WQ07555 291 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TMA16Q08687 178 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K NDD1Q08887 554 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K FLC1Q08967 793 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SVS1Q12254 260 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K CCP1P00431 361 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL22AP05749 121 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K REV1P12689 985 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ADY2P25613 283 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SRB2P34162 210 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SRX1P36077 127 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K JNM1P36224 373 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SHM1P37292 490 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YMC2P38087 329 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SAK1P38990 1142 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K DUN1P39009 513 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RVS167P39743 482 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TIF34P40217 347 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HYR1P40581 163 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K MMM1P41800 426 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO86P46956 311 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR079WP47126 109 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K MNN10P50108 393 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K EMC4P53073 190 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HOP2P53187 214 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K REG1Q00816 1014 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL014WQ02606 381 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RKM2Q03942 479 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ARA2Q04212 335 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HMI1Q12039 706 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K LCB4Q12246 624 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K BI2P03873 423 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K BI4P03879 638 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TUP1P16649 713 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K MET16P18408 261 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YJU3P28321 313 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TFB1P32776 642 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K MRP4P32902 394 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K UTH1P36135 365 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM13P38195 257 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K EFM2P38347 419 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RTT107P38850 1070 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K LTP1P40347 161 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR061WP40355 935 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SDS3P40505 327 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SER33P40510 469 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SNZ3P43545 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RTT101P47050 842 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TRF5P48561 642 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K AMA1P50082 593 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TAD1P53065 400 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TAN1P53072 289 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K FLC3P53121 802 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR063WP53749 607 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SNZ2P53824 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL062WQ02781 134 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K UME1Q03010 460 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ADI1Q03677 179 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR287CQ05881 355 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K EAF1Q06337 982 aa2.73□□□□□ -1.97
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