RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF5P18480 905 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YIH1P25637 258 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC65P29478 273 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J MET22P32179 357 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J RML2P32611 393 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC6P32844 805 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP78P33416 811 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SAP190P36123 1033 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J PSY4P38193 441 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J NPR3P38742 1146 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J PIK1P39104 1066 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YER189WP40104 122 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YAP5P40574 245 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YPS6P40583 537 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J FIG4P42837 879 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J EMW1P42842 904 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J KRE33P53914 1056 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J AQR1P53943 586 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J KTR6P54070 446 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX13P80667 386 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SSL2Q00578 843 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J BET4Q00618 327 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J GYL1Q04322 720 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL129WQ07555 291 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA16Q08687 178 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J NDD1Q08887 554 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J FLC1Q08967 793 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SVS1Q12254 260 aa2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J CCP1P00431 361 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL22AP05749 121 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J REV1P12689 985 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J ADY2P25613 283 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SRB2P34162 210 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SRX1P36077 127 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J JNM1P36224 373 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SHM1P37292 490 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YMC2P38087 329 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SAK1P38990 1142 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J DUN1P39009 513 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J RVS167P39743 482 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TIF34P40217 347 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J HYR1P40581 163 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J MMM1P41800 426 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO86P46956 311 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR079WP47126 109 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J MNN10P50108 393 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J EMC4P53073 190 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J HOP2P53187 214 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J REG1Q00816 1014 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL014WQ02606 381 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J RKM2Q03942 479 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J ARA2Q04212 335 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J HMI1Q12039 706 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J LCB4Q12246 624 aa2.74□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J BI2P03873 423 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J BI4P03879 638 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TUP1P16649 713 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J MET16P18408 261 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YJU3P28321 313 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TFB1P32776 642 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP4P32902 394 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J UTH1P36135 365 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM13P38195 257 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J EFM2P38347 419 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J RTT107P38850 1070 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J LTP1P40347 161 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR061WP40355 935 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SDS3P40505 327 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SER33P40510 469 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SNZ3P43545 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J RTT101P47050 842 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TRF5P48561 642 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J AMA1P50082 593 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TAD1P53065 400 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J TAN1P53072 289 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J FLC3P53121 802 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR063WP53749 607 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J SNZ2P53824 298 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL062WQ02781 134 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J UME1Q03010 460 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J ADI1Q03677 179 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR287CQ05881 355 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)JtW(CCA)J EAF1Q06337 982 aa2.73□□□□□ -1.97
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