RNA–Protein interactions for RNA: YMR033W

ARP9, Transcript of Component of both the SWI/SNF and RSC chromatin remodeling complexes, yeast

Gene ARP9, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP9	YMR033W	PHO11	P35842	467 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PHO12	P38693	467 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	RFX1	P48743	811 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TEL2	P53038	688 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	SUN4	P53616	420 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	RIA1	P53893	1110 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	AIM41	Q12032	185 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	CWH43	P25618	953 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	NTH1	P32356	751 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TGL1	P34163	548 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	CDS1	P38221	457 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.26	□□□□□ -1.73	not detected
ARP9	YMR033W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	FTR1	P40088	404 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MSE1	P48525	536 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MNT2	P53059	558 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PEF1	P53238	335 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	FHN1	P53279	174 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	UBX4	P54730	416 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	HLR1	Q04429	423 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TUP1	P16649	713 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TAF5	P38129	798 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TMN3	P40071	706 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MPS3	P47069	682 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MDR1	P53258	950 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	SSL2	Q00578	843 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	FDC1	Q03034	503 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PUS9	Q12069	462 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MLH3	Q12083	715 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	HOS1	Q12214	470 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ARP7	Q12406	477 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PIF1	P07271	859 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ABF1	P14164	731 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MAD2	P40958	196 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TAH11	P47112	604 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	DIN7	Q12086	430 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	CBP3	P21560	335 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	CTP1	P38152	299 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YHL041W	P38730	149 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YHL017W	P38745	532 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PCL5	P38794	229 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	KHA1	P40309	873 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	QRI7	P43122	407 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YNR071C	P53757	342 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TEP1	P53916	434 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	USV1	Q12132	391 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	URA3	P03962	267 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MSS18	P08593	268 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	FUB1	P25659	250 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YDL183C	P48569	320 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ATG4	P53867	494 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TIM50	Q02776	476 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ATG16	Q03818	150 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	TRI1	Q05024	226 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	HIM1	Q06674	414 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ACF2	Q12168	779 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ADH4	P10127	382 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	SEC12	P11655	471 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PHO81	P17442	1178 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ARG1	P22768	420 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MSH1	P25846	959 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PTH2	P34222	208 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	EHT1	P38295	451 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	PPE1	P38796	400 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	SWD1	P39706	426 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	ARG2	P40360	574 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YGR151C	P53287	111 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	MUK1	Q02866	612 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	IZH3	Q07959	543 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ARP9	YMR033W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ARP9	YMR033W	CHS7	P38843	316 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ARP9	YMR033W	NDC80	P40460	691 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ARP9	YMR033W	CTR1	P49573	406 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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