RNA–Protein interactions for RNA: YLL039C

UBI4, Transcript of Ubiquitin, yeast

Gene UBI4, Length 1,146 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBI4	YLL039C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	PSY4	P38193	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	NPP2	P39997	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	YER186C	P40101	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	ESL1	P40456	1118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	OPT1	P40897	799 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	RSC1	P53236	928 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	TIM8	P57744	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	SHS1	Q07657	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	MLH2	Q07980	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	YAP7	Q08182	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	LAA1	P39526	2014 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	PET123	P17558	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	PRR1	P28708	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	CSE2	P33308	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
UBI4	YLL039C	YET1	P35723	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	MRPL7	P36519	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	BUD16	P39988	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	ALT1	P52893	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	SSL2	Q00578	843 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	MRS2	Q01926	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	WAR1	Q03631	944 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	SFI1	Q12369	946 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBI4	YLL039C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.84	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	APL1	P27351	700 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	TRM2	P33753	639 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	APN2	P38207	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	EFM2	P38347	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	CTM1	P38818	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	FTR1	P40088	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	QDR1	P40475	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	DAS1	P47005	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ORC3	P54790	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	SPO75	Q07798	868 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ESC8	Q08119	714 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	TMA16	Q08687	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	CYC8	P14922	966 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	IME1	P21190	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ADK2	P26364	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	RPC25	P35718	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	MRPL10	P36520	322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	YHR054C	P38780	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	YHR202W	P38887	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	PEX7	P39108	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	FMP10	P40098	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	COS5	P47187	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	STB4	P50104	949 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	MET13	P53128	600 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	YNL011C	P53980	444 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	PNG1	Q02890	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	EEB1	Q02891	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	SSY1	Q03770	852 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	SLX4	Q12098	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	MNL2	Q12205	849 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	GIS3	Q12418	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	CTF3	Q12748	733 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	PRC1	P00729	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	MSH3	P25336	1018 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	THI80	P35202	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBI4	YLL039C	HEL1	P36113	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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