RNA–Protein interactions for RNA: YKL062W

MSN4, Transcript of Stress-responsive transcriptional activator, yeast

Gene MSN4, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSN4	YKL062W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SCM3	Q12334	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	INO80	P53115	1489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MET3	P08536	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RAD16	P31244	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YKR051W	P36142	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YBR259W	P38338	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RET2	P43621	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YBP2	P53169	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RNT1	Q02555	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ARA2	Q04212	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	TAF11	Q04226	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MRP7	P12687	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ELO3	P40319	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YML6	P51998	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ORC4	P54791	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YKU80	Q04437	629 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	TRM13	Q12383	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	AAC3	P18238	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RER1	P25560	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YKR018C	P36114	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	BIT2	P38346	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SIC1	P38634	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SAE2	P46946	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	AMA1	P50082	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MUP1	P50276	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PNS1	Q12412	539 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ALG7	P07286	448 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	HMG1	P12683	1054 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	MET8	P15807	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PHO81	P17442	1178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	ESL2	P36168	1195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	CKB2	P38930	258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	TGL5	Q12043	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN4	YKL062W	RAD51	P25454	400 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	PSY4	P38193	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	YIL166C	P40445	542 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	PCL10	P53124	433 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	MRPL19	P53875	158 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	FRE5	Q08908	694 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	ENT1	Q12518	454 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	RMP1	Q12530	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	JEM1	P40358	645 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	SLI1	P53304	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	TIM10	P87108	93 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	GUD1	Q07729	489 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	RED1	P14291	827 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	RPC53	P25441	422 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	PGS1	P25578	521 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	PAH1	P32567	862 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	ORC2	P32833	620 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	YBR053C	P38235	358 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	CHS7	P38843	316 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	ECM1	P39715	212 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	YIR042C	P40586	236 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	IRC6	P43615	237 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	HIM1	Q06674	414 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	TAH18	Q12181	623 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	SSM4	P40318	1319 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN4	YKL062W	GAD1	Q04792	585 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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