RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	APM2	P38700	605 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MET5	P47169	1442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	IMA1	P53051	589 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YGR266W	P53326	701 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MET14	Q02196	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PPN1	Q04119	674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	EMP46	Q12396	444 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MHP1	P43638	1398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YPR089W	O13585	888 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SEA4	P38164	1038 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SPC97	P38863	823 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	AGX1	P43567	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SAE2	P46946	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MND1	P53102	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ARP4	P80428	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ERO1	Q03103	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ALR1	Q08269	859 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SGO1	Q08490	590 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YPK2	P18961	677 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SPE2	P21182	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RAM1	P22007	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CDC15	P27636	974 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PXL1	P36166	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SNL1	P40548	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	STR2	P47164	639 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YGR017W	P53210	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PPH3	P32345	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MIF2	P35201	549 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SOH1	P38633	127 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ASK10	P48361	1146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MAL11	P53048	616 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RAP1	P11938	827 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MNL1	P38888	796 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	IBD2	P53892	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PEX25	Q02969	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	USA1	Q03714	838 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CDC25	P04821	1589 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YBP1	P38315	674 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RMD6	P39975	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	FYV10	P40492	516 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	JJJ2	P46997	583 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	LSB1	P53281	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	IFM1	P25038	676 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YGR122W	P53272	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	GTO3	Q04806	366 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	OSW2	Q12202	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	HAT1	Q12341	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CDS1	P38221	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PIK1	P39104	1066 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SYG1	P40528	902 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RSM26	P47141	266 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	GTO1	P48239	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ATG23	Q06671	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SIL1	Q08199	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CSM4	Q08955	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	LDB17	Q12342	491 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	STB3	Q12427	513 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PRI2	P20457	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
BLM10	YFL007W	SAS4	Q04003	481 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	VPS74	Q06385	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PRI1	P10363	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	IFA38	P38286	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TDA11	P38854	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SAK1	P38990	1142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CTF19	Q02732	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	SNT2	P53127	1403 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BLM10	YFL007W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms