RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W SES1P07284 462 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SWI6P09959 803 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W FRS2P15625 503 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W MBR1P23493 339 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W LTV1P34078 463 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PRX1P34227 261 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YKR073CP36153 106 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W FAT1P38225 669 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W RAD26P40352 1085 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W URM1P40554 99 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W BRE5P53741 515 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SFI1Q12369 946 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PDR18P53756 1333 aa6.08□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W TOS1P38288 455 aa6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W MET12P46151 657 aa6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YGR021WP53212 290 aa6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ROT1Q03691 256 aa6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SGD1Q06132 899 aa6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W UPC2Q12151 913 aa6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data6.07□□□□□ -1.44not detected
VHS1YDR247W NCB2Q92317 146 aa6.07□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data6.06□□□□□ -1.44 RIP-Chip
VHS1YDR247W BEM4P39011 633 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W IES5P40060 125 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W CTF18P49956 741 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W MRPS35P53292 345 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SNO2P53823 222 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ZDS2P54786 942 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PLB2Q03674 706 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PFK1P16861 987 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W STE14P32584 239 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PTH2P34222 208 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W NUP133P36161 1157 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W APN2P38207 520 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W RRP8P38961 392 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W CIN4P39110 191 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PFA3P42836 336 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SET2P46995 733 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YBP2P53169 641 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W HOL1P53389 586 aa6.06□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W HIS5P07172 385 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W LAM1P38851 1228 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YHR202WP38887 602 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W HIS6P40545 261 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SMC3P47037 1230 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W GCV2P49095 1034 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W CNM67P53865 581 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ASI2P53895 289 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YMR210WQ03649 449 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ASM4Q05166 528 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YLR407WQ06070 228 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YDL177CQ12257 170 aa6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W TPM1P17536 199 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W RDS1P25611 832 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W NGG1P32494 702 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W MRS6P32864 603 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SPO22P40511 975 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W MLC1P53141 149 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W VPS60Q03390 229 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ALE1Q08548 619 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W GPR1Q12361 961 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SWM1Q12379 170 aa6.04□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W SWI1P09547 1314 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W GLN4P13188 809 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ATP12P22135 325 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data6.03□□□□□ -1.44 RIP-Chip
VHS1YDR247W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YHL041WP38730 149 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W VHR1P40522 640 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W VID28P40547 921 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YGL242CP53066 181 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W ARP5P53946 755 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W PKH1Q03407 766 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YDL121CQ07541 149 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W GPB1Q08886 897 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W HMI1Q12039 706 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W YPL150WQ12152 901 aa6.03□□□□□ -1.44
VHS1YDR247W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W GPA1P08539 472 aa6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W LPD1P09624 499 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W EMC1P25574 760 aa6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CHA4P43634 648 aa6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W NCS6P53088 359 aa6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W BRE4Q07660 1125 aa6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PSK2Q08217 1101 aa6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SLM3Q12093 417 aa6.02□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SEC21P32074 935 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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